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求助“硝基自由基夺取苯胺氮氢键结构中的氢原子”的几个问题

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发布时间: 2023-12-1 13:10

正文摘要:

本帖最后由 gezq 于 2023-12-1 20:22 编辑 硝基自由基夺取苯胺氮氢键结构中的氢原子 前言     在上一篇帖子(http://bbs.keinsci.com/thread-41322-1-1.html)中,笔者谈到硝基自由基得电子释放的能 ...

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gezq 发表于 Post on 2023-12-27 21:14:14
DDb 发表于 2023-12-22 15:07
之前我找过这个过渡态,用的M062 但是一直没成功,最近看到您发的,所以想向您借鉴一下,如果可以能给我 ...

我也没有找到,有两个虚频,如果找到了,我就写博文了
DDb 发表于 Post on 2023-12-22 15:07:31
gezq 发表于 2023-12-21 16:11
所用基组,泛函,均已在正文中详细阐述啦

之前我找过这个过渡态,用的M062 但是一直没成功,最近看到您发的,所以想向您借鉴一下,如果可以能给我发一下输入文件吗?
gezq 发表于 Post on 2023-12-21 16:11:10
DDb 发表于 2023-12-20 14:53
可不可以发一下你的输入文件

所用基组,泛函,均已在正文中详细阐述啦
DDb 发表于 Post on 2023-12-20 14:53:23
可不可以发一下你的输入文件
gezq 发表于 Post on 2023-12-1 20:10:22
Strange 发表于 2023-12-1 19:57
你这个新结构跑个IRC看看?感觉可能是M06-2X和B3LYP-D3(BJ)的势能面不太一样,我之前就碰到过B3LYP-D3(BJ ...

好的,谢谢,我两种方法都试一下,如果可行,回头再写一篇交流贴
Strange 发表于 Post on 2023-12-1 19:57:53
gezq 发表于 2023-12-1 19:51
是的,相比之下,更低了

你这个新结构跑个IRC看看?感觉可能是M06-2X和B3LYP-D3(BJ)的势能面不太一样,我之前就碰到过B3LYP-D3(BJ)找不到中间体,过渡态(一优化就直接到产物去了),但是M06-2X就能找到对应的中间体和过渡态。这种时候就别切换泛函了吧,不然可能出问题。一般这种情况我更相信M06-2X,在我上个问题中也确实M06-2X得到的结果更符合化学常识。但你又有虚频消不掉的问题,看你自己的选择了吧
gezq 发表于 Post on 2023-12-1 19:51:10
Strange 发表于 2023-12-1 19:26
这个新的过渡态的电子能量如何?还是比起始物低吗?

是的,相比之下,更低了
Strange 发表于 Post on 2023-12-1 19:26:49
gezq 发表于 2023-12-1 17:52
使用B3LPY-D3(BJ)/def2-TZVP,也找到了过渡态,确认没有问题

这个新的过渡态的电子能量如何?还是比起始物低吗?
gezq 发表于 Post on 2023-12-1 16:54:07
Strange 发表于 2023-12-1 16:42
按照我的理解,你table1里的EE表示的是高精度方法下得到的电子能量(?),这是否说明在高精度方法下,你找 ...

(1)是高精度下的电子能;
(2)好的,我试试。当时的确没想这么多,直接用6-31G(d)跑的
Strange 发表于 Post on 2023-12-1 16:42:30
按照我的理解,你table1里的EE表示的是高精度方法下得到的电子能量(?),这是否说明在高精度方法下,你找的这个过渡态可能不对了?你用高精度方法再找下过渡态看看?反正你这个体系这么小,反应还涉及H转移,基组连H的极化都不加也太烂了
gezq 发表于 Post on 2023-12-1 14:10:45
Strange 发表于 2023-12-1 13:58
反应物最后得到的波函数都稳定吗?

是稳定的
Strange 发表于 Post on 2023-12-1 13:58:12
反应物最后得到的波函数都稳定吗?

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