李潞琪 发表于 2024-1-30 00:24 当前是分子间相互作用,应当用sobEDAw(一般推荐结合B3LYP-D3(BJ)),此时不适合用M06-2X-D3,下文明确说了 使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析 http://sobereva.com/685(http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html) |
sobereva 发表于 2024-1-28 02:42 抱歉老师我没太懂您的意思,分子力场做的能量分解分析结果是:静电相互作用-40.49kJ/mol,也就是-9.69kcal/mol,色散作用是-323.62kJ/mol,也就是-77.42kcal/mol,色散远大于静电。sobEDA的结果:静电相互作用-180.19kcal/mol,色散作用是-13.24kcal/mol,静电远大于色散。两种能量分解分析结果不一致,所以没办法判断静电作用和色散哪个更大。 再次谢谢老师,给老师添麻烦了。 |
李潞琪 发表于 2024-1-27 16:20 没看出哪相反了,至少当前没有任何具体信息 氢键的物理成份哪种为重,严重取决于氢键特征,看下文,只能说一般强度的氢键主要是静电作用 透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度:一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍 http://sobereva.com/513(http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html) pi-pi堆积的内在本质本来就是色散吸引,而不是“主要是”,参考下文的讨论 全面探究18碳环独特的分子间相互作用与pi-pi堆积特征 http://sobereva.com/572(http://bbs.keinsci.com/thread-19660-1-1.html) |
sobereva 发表于 2024-1-27 00:43 好的,谢谢老师。 本来做能量分解分析的初衷是想看一下氢键相互作用和pi-pi堆积作用哪个更大,我的想法是,氢键的主要是静电作用,pi-pi堆积作用主要是是色散,想大概比较一下。但是这两个结果产生了相反的结果。 |
把单位统一了再比 -58.24 kcal/mol相比于-196.33 kJ/mol对应的-46.92 kcal/mol,根本没相差多少,是非常正常的分子力场和DFT计算结果的差异程度 |
分子力场本来就粗糙,和DFT结果数值不一样很正常。而且从数值上来说-58.24 kcal/mol和-196.33 kJ/mol这个差距还能接受(对于力场和DFT的差别,如果力场合适、电荷合适,也许还能更接近) |
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