图2是这个分子的能量最低结构，因为此时有分子内氢键。图1是亚稳结构
实际动力学模拟过程中这两种构象都会出现，各有一定比率，可以对轨迹做统计，当然图2的概率高得多，根据Boltzmann分布可知。参考下文
根据Boltzmann分布计算分子不同构象所占比例
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这种结构变化是动态变化的吗？我个人认为这种细微的结构变化对后续模拟结果影响不大。
个人见解。