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求助:模拟聚合物很多链跑出盒子整体显得结果并不理想的问题;退火温度生不上去问题

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发布时间: 2024-2-25 19:37

正文摘要:

本帖最后由 MGRACE 于 2024-2-25 19:45 编辑 目前在模拟一种接枝两性离子聚合物,能量最小化后半各项异性退火模拟后进行密度,回转半径等指标判断达到了平衡。但还是存在部分真空区域,而且很多聚合物链条跑出盒 ...

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Seyilaxa 发表于 Post on 2024-2-27 20:00:43
MGRACE 发表于 2024-2-26 10:55
温度过高崩溃有什么好的解决办法么?想模仿一些文献里升温后降温的方法看看结果会不会好一些,尝试论坛里 ...

没有必要不需要高温后降温,从你模拟结果来看显示完整分子和让分子都在盒子里不可兼得
MGRACE 发表于 Post on 2024-2-26 10:55:04
Seyilaxa 发表于 2024-2-26 07:43
那不是真空区,是周期性边界条件下另一侧盒子外的部分。温度过高模拟崩溃正常

温度过高崩溃有什么好的解决办法么?想模仿一些文献里升温后降温的方法看看结果会不会好一些,尝试论坛里一些解决崩溃的方法后还是崩溃
MGRACE 发表于 Post on 2024-2-26 10:43:08
slxc920113 发表于 2024-2-25 22:26
聚合物那么长,跨盒子不是很正常吗?

但是我看的很多聚合物模拟的链比我这个长的多,虽然也有跨盒子的部分但没我这个夸张(比如从文献里面截取的第三张图),我的很多链都竖起来跨过盒子所以感觉很不理想。
Seyilaxa 发表于 Post on 2024-2-26 07:43:36
那不是真空区,是周期性边界条件下另一侧盒子外的部分。温度过高模拟崩溃正常
slxc920113 发表于 Post on 2024-2-25 22:26:39
聚合物那么长,跨盒子不是很正常吗?

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