求助：模拟聚合物很多链跑出盒子整体显得结果并不理想的问题；退火温度生不上去问题

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发布时间: 2024-2-25 19:37

本帖最后由 MGRACE 于 2024-2-25 19:45 编辑目前在模拟一种接枝两性离子聚合物，能量最小化后半各项异性退火模拟后进行密度，回转半径等指标判断达到了平衡。但还是存在部分真空区域，而且很多聚合物链条跑出盒 ...

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Seyilaxa 发表于 Post on 2024-2-27 20:00:43

MGRACE 发表于 2024-2-26 10:55
温度过高崩溃有什么好的解决办法么？想模仿一些文献里升温后降温的方法看看结果会不会好一些，尝试论坛里 ...

没有必要不需要高温后降温，从你模拟结果来看显示完整分子和让分子都在盒子里不可兼得

MGRACE 发表于 Post on 2024-2-26 10:55:04

Seyilaxa 发表于 2024-2-26 07:43
那不是真空区，是周期性边界条件下另一侧盒子外的部分。温度过高模拟崩溃正常

温度过高崩溃有什么好的解决办法么？想模仿一些文献里升温后降温的方法看看结果会不会好一些，尝试论坛里一些解决崩溃的方法后还是崩溃

MGRACE 发表于 Post on 2024-2-26 10:43:08

slxc920113 发表于 2024-2-25 22:26
聚合物那么长，跨盒子不是很正常吗？

但是我看的很多聚合物模拟的链比我这个长的多，虽然也有跨盒子的部分但没我这个夸张（比如从文献里面截取的第三张图），我的很多链都竖起来跨过盒子所以感觉很不理想。

Seyilaxa 发表于 Post on 2024-2-26 07:43:36

那不是真空区，是周期性边界条件下另一侧盒子外的部分。温度过高模拟崩溃正常

slxc920113 发表于 Post on 2024-2-25 22:26:39

聚合物那么长，跨盒子不是很正常吗？

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