搜索过渡态时加入了显示水溶剂做了NVT动力学计算后是否还需要进行结构优化？

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发布时间: 2024-3-29 22:00

各位老师好，我用CP2K在计算一个催化反应在水溶剂中的反应机理（反应物是含笨环有机物，催化剂是mgo，都是固体），我了解到可以用GROMACS的insert-molecules把指定数量的水分子插入到盒子的真空区里以模拟水溶剂环境 ...

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科研好难 发表于 Post on 2024-3-30 10:06:58

sobereva 发表于 2024-3-30 03:56
可以。对于纯泛函，耗时很大程度取决于格点数，删水分子未必节约得了多少耗时。实测便知

温度需要。NVT ...

好的，谢谢sob老师的耐心解答！

sobereva 发表于 Post on 2024-3-30 03:56:14

可以。对于纯泛函，耗时很大程度取决于格点数，删水分子未必节约得了多少耗时。实测便知

温度需要。NVT没法控压，让水能包住反应物就算达到目的了

最好优化

完全取决于跑动力学的目的何在。自行根据实际目的和要求决定

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