可以试试用chimera配合modeller进行补全

缺柔性末端的残基大部分时候可以直接无视，通常不是感兴趣的区域

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的严重不恰当标题 “计算生物学” 改了，以后务必注意！下次将删帖+扣分处理。

You can use alphafold or something like that and use the pdb you downloaded as a template