请问下载的蛋白质pdb结构存在许多缺失残基，缺失原子，应怎样操作进行补全呢

lfm · 发表于 Post on 2024-4-24 21:15:53

大家好，请问下载的蛋白质pdb结构存在许多缺失残基，缺失原子，应怎样操作进行补全呢

rpestana94 · 发表于 Post on 2024-4-25 00:02:42

You can use alphafold or something like that and use the pdb you downloaded as a template

sobereva · 发表于 Post on 2024-4-25 04:44:05

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的严重不恰当标题 “计算生物学” 改了，以后务必注意！下次将删帖+扣分处理。

sobereva · 发表于 Post on 2024-4-25 05:56:42

缺柔性末端的残基大部分时候可以直接无视，通常不是感兴趣的区域

frank666 · 发表于 Post on 2024-4-30 16:46:54

可以试试用chimera配合modeller进行补全

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[综合交流] 请问下载的蛋白质pdb结构存在许多缺失残基，缺失原子，应怎样操作进行补全呢