牧生 发表于 2024-5-22 22:05
用更高版本的gmx即可，我用的2022.6
也可以去注释那一行代码。具体的在论坛里搜一下就能找到。

好的谢谢老师，我试试

12313 发表于 2024-5-22 21:58
老师，之后我又依次进行了cmake3 .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/data/sob/gromacs-2020.6和
make install  ...

用更高版本的gmx即可，我用的2022.6
也可以去注释那一行代码。具体的在论坛里搜一下就能找到。

http://bbs.keinsci.com/thread-42578-1-1.html


http://bbs.keinsci.com/thread-31440-1-1.html

12313 发表于 2024-5-22 20:35
谢谢老师，另外我还想问一下，GCC编译器的位置是指gcc这个文件的位置吗？

是的，-DCMAKE_C_COMPILER是gcc的位置，-DCMAKE_CXX_COMPILER是g++的位置，另外cmake命令需要一次写完，不要分布执行，如我的命令：

1. cmake .. -DGMX_GPU=CUDA -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/gromacs-2023.3-float-threadmpi-gpu -DCUDA_TOOLKIT_ROOT_DIR=/usr/local/cuda -DCMAKE_PREFIX_PATH=/opt/tool/fftw-3.3.10-float -DCMAKE_C_COMPILER=/opt/tool/gcc-13.2.0/bin/gcc -DCMAKE_CXX_COMPILER=/opt/tool/gcc-13.2.0/bin/g++ -DGMX_SIMD=AVX_512

复制代码

Dempey 发表于 2024-5-22 20:17
cmake使用选项“-DCMAKE_C_COMPILER=”、“-DCMAKE_CXX_COMPILER=”指定GCC编译器的位置

谢谢老师，另外我还想问一下，GCC编译器的位置是指gcc这个文件的位置吗？

cmake使用选项“-DCMAKE_C_COMPILER=”、“-DCMAKE_CXX_COMPILER=”指定GCC编译器的位置

牧生 发表于 2024-5-22 19:30
参考了
http://sobereva.com/457
我的是这样的命令，

谢谢你的回复，其实我是打算分两步来进行的
先是cmake3 .. -DGMX_SIMD=AVX_512
然后是cmake3 .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=路径

参考了
http://sobereva.com/457
我的是这样的命令，
cmake3 .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/jing/gmx2022.5 -DGMX_SIMD=AVX_512 -DGMX_GPU=CUDA -DCUDA_TOOLKIT_ROOT_DIR=/usr/local/cuda

而不是光秃秃的 cmake3 .. -DGMX_SIMD=AVX_512