为何使用cp2k模拟自由基与富勒烯反应，两者越来越远？

查看数: 869 | 评论数: 7 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2024-6-11 11:28

我使用的是multiwfn创建的cp2k输入文件，按道理应该是靠近，请各位老师解答

回复 Reply

Huschein 发表于 Post on 2024-6-12 12:31:49

反应是有能垒的，你想直接看到这个过程有点难，可以做个MetaD增强采样诱导这个过程

sobereva 发表于 Post on 2024-6-12 12:25:32

zhangs 发表于 2024-6-12 09:45
感谢sob老师的解惑，那请问下我应该选择什么基组和方法

加D3
仔细看
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？”
http://sobereva.com/413

如果加了D3还这样，设置初速度，让自由基往富勒烯这边打过来

zhangs 发表于 Post on 2024-6-12 09:45:16

sobereva 发表于 2024-6-12 04:41
哪能不带色散校正
两个部分之间本来就没有静电吸引作用，再加上PBE描述不了分子间的色散吸引作用，分离开 ...

感谢sob老师的解惑，那请问下我应该选择什么基组和方法

sobereva 发表于 Post on 2024-6-12 04:41:41

哪能不带色散校正
两个部分之间本来就没有静电吸引作用，再加上PBE描述不了分子间的色散吸引作用，分离开是极其正常的

nusiew 发表于 Post on 2024-6-11 19:43:37

是不是对输出轨迹没有进行周期性变换呢？用的是真实原子坐标？

zhangs 发表于 Post on 2024-6-11 17:03:07

Huschein 发表于 2024-6-11 16:10
什么条件都不说，怎么设置也没说

抱歉老师，我是想模拟富勒烯对自由基有清除或者淬灭作用，我这里用的是cp2k跑动力学，方法和基组是PBE/ TZV2P-MOLOPT-GTH,温度设置的是300K，但是这两个分子越来越远了，不知道是哪里出了问题

Huschein 发表于 Post on 2024-6-11 16:10:36

什么条件都不说，怎么设置也没说

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register