求助：超算跑mdrun出现Update groups can not be used for this system because th...

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发布时间: 2024-6-25 22:54

本帖最后由 Changtx 于 2024-6-25 22:54 编辑新手小白，跑gromacs，体系是有机离子水溶液的分相模拟，通过packmol构建初始结构，进行em、100ps nvt、2ns npt 、10ns pro-md-npt，使用超算平台GPU版本2023.2，运 ...

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Changtx 发表于 Post on 2024-6-26 13:01:16

那老师我想请问该如何把这个警告消除掉呢，还有就是我的力场是用OPLS-AA，经过LigParGen网站获得到的itp文件，可能是因为电荷我没有进行修改导致水分子和NHD（聚乙二醇二甲醚）混合，我看社长另一篇帖子说修改为1.2*CM5，您看可能是这方面出了问题吗？

sobereva 发表于 Post on 2024-6-26 03:36:10

对模拟结果没影响，只不过此时默认的-update gpu相当于关了，会损失GPU加速性能

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