关于蛋白配体复合物体系的RMSD平衡问题

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发布时间: 2024-7-20 17:46

本帖最后由 12313 于 2024-7-20 17:48 编辑各位老师好，我的体系是蛋白配体复合物，我之前对其进行了50ns的模拟分析，骨架RMSD曲线如图所示，可以明显观察到在20ns后达到平衡。之后我又进行了50ns的续跑，得到了 ...

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fhh2626 发表于 Post on 2024-7-20 21:06:03

你这个再跑跑吧，时间太短了，不过RMSD的绝对值倒是也不大，可能初始结构就还行

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