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计算相互作用能方法的选择

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发布时间: 2016-12-20 09:28

正文摘要:

请问老师,我的优化是在M062X/6-311G**下进行的,然后用这这三种方法进行相互作用能的计算,这可以来证明1,2,3复合物都是稳定的,并且纵向比较稳定性3大于2大于1吗?(复合物是200 C H O N原子)

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wweng 发表于 Post on 2016-12-21 12:10:24
sobereva 发表于 2016-12-21 12:08
可以低精度的方法和高精度的方法比

如果用了几种方法,可靠性都差不多或者很难说哪个更准,若它们能得 ...

谢谢老师的讲解,明白了。也对接下来要做的心里大致有了底,非常感谢
sobereva 发表于 Post on 2016-12-21 12:08:06
wweng 发表于 2016-12-21 10:56
好的!谢谢您。对了老师,您前面说的可以横向比较不同方法算出来的相互作用能,是怎样个比较法?一般可以 ...

可以低精度的方法和高精度的方法比

如果用了几种方法,可靠性都差不多或者很难说哪个更准,若它们能得到相同的结论,也算是相互印证
wweng 发表于 Post on 2016-12-21 10:56:02
sobereva 发表于 2016-12-21 10:38
不用重新优化,单点索性就甭加D3了

好的!谢谢您。对了老师,您前面说的可以横向比较不同方法算出来的相互作用能,是怎样个比较法?一般可以得出些什么呢?
sobereva 发表于 Post on 2016-12-21 10:38:43
wweng 发表于 2016-12-21 10:09
恩恩,老师正好说中我的担忧,想加上d3再优化下,可时间太紧张,不知道该该怎样做最好。谢谢老师的解答

不用重新优化,单点索性就甭加D3了
wweng 发表于 Post on 2016-12-21 10:09:54
sobereva 发表于 2016-12-21 09:59
原理上可以。
算能量最好加D3,结果还会有进一步改进,不过一个后患是审稿人可能问你为什么优化不加D3 ...

恩恩,老师正好说中我的担忧,想加上d3再优化下,可时间太紧张,不知道该该怎样做最好。谢谢老师的解答
sobereva 发表于 Post on 2016-12-21 09:59:32
wweng 发表于 2016-12-21 09:57
恩,那老师我优化的时候不加D3,算能量的话可以加吗?


原理上可以。
算能量最好加D3,结果还会有进一步改进,不过一个后患是审稿人可能问你为什么优化不加D3。
wweng 发表于 Post on 2016-12-21 09:57:48
sobereva 发表于 2016-12-21 09:43
优化用这个级别足矣

恩,那老师我优化的时候不加D3,算能量的话可以加吗?
sobereva 发表于 Post on 2016-12-21 09:43:10
wweng 发表于 2016-12-21 09:27
谢谢老师的耐心讲解!我的体系用的M062X/6-311g**优化,我觉得应该够了,体系大而且多,要再加D3全部优化 ...

优化用这个级别足矣
wweng 发表于 Post on 2016-12-21 09:27:57
sobereva 发表于 2016-12-21 09:06
看各种弱相互作用的benchmark文章
普通DFT级别中,M06-2X-D3的精度是几乎最高的。在我的《乱谈DFT-D》博 ...

谢谢老师的耐心讲解!我的体系用的M062X/6-311g**优化,我觉得应该够了,体系大而且多,要再加D3全部优化时间估计也不够用了。所以只是在计算相互作用能的时候多选择了上述两种方法来做
sobereva 发表于 Post on 2016-12-21 09:06:10
teller3531 发表于 2016-12-21 08:44
那sob老师算相互作用能,不同方法的准确性该怎么比较那

看各种弱相互作用的benchmark文章
普通DFT级别中,M06-2X-D3的精度是几乎最高的。在我的《乱谈DFT-D》博文里的方法推荐里有
如果嫌这个还不够,还想更好点,就上比较好的双杂化泛函
teller3531 发表于 Post on 2016-12-21 08:44:21
那sob老师算相互作用能,不同方法的准确性该怎么比较那
sobereva 发表于 Post on 2016-12-21 02:32:31
wweng 发表于 2016-12-20 13:45
好的,谢谢老师的解答,那就是算出来的相互作用能更大,也不能说明方法更适合对吗?




根本大小就没法用来判断任何合理性,原理上就没这说法。
wweng 发表于 Post on 2016-12-20 13:45:30
本帖最后由 wweng 于 2016-12-20 13:48 编辑
sobereva 发表于 2016-12-20 13:22
可以横向比较不同方法算出来的相互作用能,不同级别不能比的是绝对能量
谁高谁低没法说明谁好谁不好

好的,谢谢老师的解答,那就是算出来的相互作用能更大,也不能说明方法更适合对吗?
sobereva 发表于 Post on 2016-12-20 13:22:10
wweng 发表于 2016-12-20 12:57
谢谢老师的回答。您说过不同方法计算的能量没有可比性,所以此表格不能横向比较,并且也不能说明计算得到 ...

可以横向比较不同方法算出来的相互作用能,不同级别不能比的是绝对能量
谁高谁低没法说明谁好谁不好

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