本帖最后由 打豆豆的灰鸭 于 2024-7-29 10:39 编辑 sobereva 发表于 2024-7-29 03:08 老师，我把分子两两组合，除去含bf4离子的，其他能量最小化都是像上图一样，但后续可以跑nvt，那他提示不收敛有影响吗 然后我把单独的bf4进行能量最小化，出现了上图的情况（我把图贴在了1#，老师看一下，我重新上传了bf4。itp) |
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按http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8说的思路排查，从简单到复杂，先确保模拟单个BF4没问题再说混合物的。当前BF4的拓扑信息里都没有键角项，明显有问题 能量极小化过程不会自动修改原子顺序，注意检查grompp过程产生的信息 |
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