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请问为什么模拟结果的阴阳离子聚集在一起，金属阳离子未与溶剂分子形成配位

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szg

发布时间: 2024-8-23 20:31

正文摘要:

模拟基本情况： 1、按照教程http://sobereva.com/531计算RESP2电荷（阴离子用的ma-TZVP） 2、top文件中使用的力场为oplsaa 遇到的问题如下图所示（黄色雾状为处理过的溶剂分子DME，粉色为金属离子Na，蓝色为阴离 ...

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szg 发表于 Post on 2024-8-24 08:09:48

sobereva 发表于 2024-8-24 06:50
RESP/RESP2主要是给AMBER系力场用的，OPLS-AA适合用的原子电荷按下文计算
计算适用于OPLS-AA力场做模拟的1 ...

明白了，谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2024-8-24 06:50:32

RESP/RESP2主要是给AMBER系力场用的，OPLS-AA适合用的原子电荷按下文计算
计算适用于OPLS-AA力场做模拟的1.2*CM5原子电荷的懒人脚本
http://sobereva.com/585（http://bbs.keinsci.com/thread-21462-1-1.html）

建议RESP电荷结合sobtop产生的GAFF2的拓扑文件

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