分清楚Gaussian和GaussView,后者才是建模程序 光从搭结构角度来说,用GaussView调整键长键角二面角的工具,结合适当对片段进行平移旋转就能弄个凑合的初始结构。操作细节远程没法说清楚,北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KEQC_content.html)里非常详细讲了,参加一遍就都明白了 |
在gaussview中可以用“Modify Bond”、“Modify Angle”、“Modify Dihedral”调整自己建的模型中相应的键长键角以及二面角,调整至更接近实际的构型的情况下再去优化结构可以节约时间。 |
这种不知道构型长什么样子的,要先做构型搜索,选几个合适的再往后做http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html |
这种体系,完全可以选择合适的计算级别,直接上DFT进行结构优化。泛函的选择:参考卢老师的《简谈量子化学计算中DFT泛函的选择》(http://sobereva.com/272)。基组的选择:参考卢老师的《谈谈量子化学中基组的选择》(http://sobereva.com/336)。 |
这个直接先简单优化一下就可以吧 |
用UFF、GFN-FF、GFN2-xTB等方法,粗优化一下 |
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