求助高斯对B杂Si的五元环进行结构的建模

终身计化 · 发表于 Post on 2024-10-30 16:53:49

求助各位大神，本人是初学量子化学和高斯的小白，准备用高斯对B杂Si的五元环进行建模。但现在不是很会调整键长键角，问老师好几次他也含糊其辞，想请教各位大神有什么方法可以将其调整为较为合理的初始结构呢？跪拜各位佬

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-10-30 17:19:02

用UFF、GFN-FF、GFN2-xTB等方法，粗优化一下

shaozhenwu · 发表于 Post on 2024-10-30 19:06:21

这个直接先简单优化一下就可以吧

JCenter · 发表于 Post on 2024-10-30 22:52:24

这种体系，完全可以选择合适的计算级别，直接上DFT进行结构优化。泛函的选择：参考卢老师的《简谈量子化学计算中DFT泛函的选择》（http://sobereva.com/272）。基组的选择：参考卢老师的《谈谈量子化学中基组的选择》（http://sobereva.com/336）。

pal · 发表于 Post on 2024-10-31 09:01:27

这种不知道构型长什么样子的，要先做构型搜索，选几个合适的再往后做http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html

白米醋 · 发表于 Post on 2024-10-31 12:19:28

在gaussview中可以用“Modify Bond”、“Modify Angle”、“Modify Dihedral”调整自己建的模型中相应的键长键角以及二面角，调整至更接近实际的构型的情况下再去优化结构可以节约时间。

sobereva · 发表于 Post on 2024-10-31 17:07:29

分清楚Gaussian和GaussView，后者才是建模程序

光从搭结构角度来说，用GaussView调整键长键角二面角的工具，结合适当对片段进行平移旋转就能弄个凑合的初始结构。操作细节远程没法说清楚，北京科音初级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KEQC_content.html）里非常详细讲了，参加一遍就都明白了

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