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关于手动计算的构象分布与Shermo计算的结果不同的问题

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发布时间: 2025-1-6 18:44

正文摘要:

各位老师好,我本想计算油酸分子加上一个水合质子的热力学数据,结合sob老师《使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索》和《使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据 ...

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pxc12310 发表于 Post on 2025-1-7 11:18:54
sobereva 发表于 2025-1-7 02:09
提到我的博文时记得主动把链接给出。这次给你加上了。

“freqchk功能提取了343.15K下的热力学校正量”  ...

感谢sob老师的指正,我下次会注意的
sobereva 发表于 Post on 2025-1-7 02:09:18
提到我的博文时记得主动把链接给出。这次给你加上了。

“freqchk功能提取了343.15K下的热力学校正量” 毫无意义,算弱相互作用体系必须用Shermo,其默认用的QRRHO模型比起freqchk用的RRHO对于这种情况给出的自由能强多了,Shermo的博文里都明确说了。

再次仔细、完整阅读
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html


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