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离子片段相互作用计算设置求助

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发布时间: 2025-6-24 20:05

正文摘要:

本帖最后由 moziyuan 于 2025-6-24 20:23 编辑 请问各位,像下面这个体系计算相互作用的话片段电荷如何设置?整体是带两个正电荷的三氮唑和三个氨气分子,结构优化后质子转移了,计算质子化的氨和三氮唑的相互作 ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-6-30 05:42:28
moziyuan 发表于 2025-6-27 10:12
sob老师好,我体系里初始是一个带+2电荷的三氮唑和三个NH3分子,结构优化后三氮唑阳离子的三个质子显然转 ...

算带净电的物质,实际是溶剂环境下的情况,一定要考虑溶剂模型,很容易产生定性影响(如决定是否会自发发生质子转移)。
通过SMD溶剂模型描述离子液体溶剂环境的方法
http://sobereva.com/431http://bbs.keinsci.com/thread-10607-1-1.html

先带上再说
18217265596 发表于 Post on 2025-6-27 12:51:04
moziyuan 发表于 2025-6-27 10:12
sob老师好,我体系里初始是一个带+2电荷的三氮唑和三个NH3分子,结构优化后三氮唑阳离子的三个质子显然转 ...

问题是这样的质子转移很合理。
moziyuan 发表于 Post on 2025-6-27 10:12:03
sobereva 发表于 2025-6-26 05:36
如果要重复别人的文章,仔细看:
谈谈重复不出来计算化学文献里的数据的可能原因
http://sobereva.com/67 ...

sob老师好,我体系里初始是一个带+2电荷的三氮唑和三个NH3分子,结构优化后三氮唑阳离子的三个质子显然转移到氨上了,我的目的是计算三氮唑阳离子对氨气的吸附作用,这应该是需要计算二者的相互作用,由于三个质子转移了,此时我认为应该不能计算三氮唑和氨气两个片段的相互作用,而是失去质子后的三氮唑和三个氨正离子的相互作用,但是对于这种情况下如何设定片段电荷有些疑惑。
以上的结构优化是在气相下进行的,暂时未加溶剂,实际实验的溶剂是三氮唑阳离子和四苯基硼离子形成的离子液体。
sobereva 发表于 Post on 2025-6-26 05:36:12
如果要重复别人的文章,仔细看:
谈谈重复不出来计算化学文献里的数据的可能原因
http://sobereva.com/678http://bbs.keinsci.com/thread-38911-1-1.html

主动说清楚你希望计算哪个片段和哪个片段的相互作用、实际目的是什么。否则没法回答
18217265596 发表于 Post on 2025-6-24 22:26:53
1,为什么不加溶剂模型? 这会影响质子是否转移

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