求助MD退火模拟，温度没有按照设定降低

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发布时间: 2025-11-21 17:40

各位老师好，我最近在在跑一个核酸体系的MD模拟，我先跑完了293.15K的常规的预平衡，然后准备跑退火MD，下面是我的退火的mdp，我是想把体系的温度梯度下降，在每个温度都跑一段MD。然后我发现，我的体系没办法按照我 ...

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zhijiu 发表于 Post on 2025-11-21 19:03:28

我看到了，谢谢老师。发现我时间给的有问题

，我以为我设定的0 15ns 15.2ns 30ns。。。

Dempey 发表于 Post on 2025-11-21 18:19:40

本帖最后由 Dempey 于 2025-11-21 18:37 编辑

你的模拟时间是60ns，而你设置的退火的时间分别是0 15ns 152ns 302ns 304ns，所以降温不明显。你可以设置成：

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