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使用VMD呈现分子静电势分布的时候如何更改原子的颜色

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thor

发布时间: 2026-6-22 15:28

正文摘要:

我使用社长提供的静电势分析脚本（使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示） - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元）绘制了自己体系的静电势分布图。我 ...

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sobereva 发表于 Post on 2026-6-22 18:24:49

就是新建一个rep选中一个原子（参考下文），coloring method设color ID，指定你要的颜色就完了
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

注意这个原子的显示方式不要和显示所有原子的相同，否则可能被盖住。可以这个原子的球半径（如CPK模式的sphere scale）设得比默认稍微大一丁点

PLwang 发表于 Post on 2026-6-22 17:15:28

color Name C gray
也可以自行使用VMD的Color更改

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