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CDA分析带电的不同,结果差异较大的疑惑!

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发布时间: 2017-5-28 14:56

正文摘要:

感谢SOB对之前帖子的及时回复,受益匪浅。为了便于后来者根据问题的标题检索内容,我把新的问题提出来请教,就不追贴了。谢谢! 针对Al和色氨酸(羧基脱质子)的配位进行CDA分析,实际的实验中,是微量硫酸铝滴加 ...

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lao7 发表于 Post on 2017-5-29 15:56:56
sobereva 发表于 2017-5-29 11:09
我说的是"12 Set orbital energy shifting value”,这是对图中三列轨道的能量值进行人为的调整,便于A ...

明白了,谢谢!
sobereva 发表于 Post on 2017-5-29 11:09:23
lao7 发表于 2017-5-29 06:53
你说的作图的时候移动,应该是multiwfn里面的选项9:set shifting of composition labels吗?图1和贴的图 ...


我说的是"12 Set orbital energy shifting value”,这是对图中三列轨道的能量值进行人为的调整,便于A和B能级相差很大时图上看得清楚
而set shifting of composition labels是对标签在图中的位置进行移动,免得有些标签相互挡着看不清楚,完全不影响轨道能量
上面这两个和计算时用的SCF=vshift=x完全无关
冰释之川 发表于 Post on 2017-5-29 08:49:51
sobereva 发表于 2017-5-29 06:41
我建议对于CDA作图时用“能级移动”而不是vshift这个词,否则有歧义。因为vshift是指的帮助SCF收敛的方法, ...

是不是CDA里做轨道相互作用图,其实纵坐标的绝对刻度没有大意义,最重要的还是看轨道成分与贡献率?所以我们可以通过“能级移动”来更加方便的考察。
lao7 发表于 Post on 2017-5-29 06:53:46
本帖最后由 lao7 于 2017-5-29 06:59 编辑
sobereva 发表于 2017-5-29 06:41
我建议对于CDA作图时用“能级移动”而不是vshift这个词,否则有歧义。因为vshift是指的帮助SCF收敛的方法, ...

你说的作图的时候移动,应该是multiwfn里面的选项9:set shifting of composition labels吗?图1和贴的图3稍许有差别,图1是AB优化后,分别拆开对A,B和AB计算单点能。能级没有移动。
图3是,AB,A,B分别优化后,直接进行能级移动作图。
sobereva 发表于 Post on 2017-5-29 06:41:40
我建议对于CDA作图时用“能级移动”而不是vshift这个词,否则有歧义。因为vshift是指的帮助SCF收敛的方法,计算时候vshift设多大,对于结果的轨道能级都是没有影响的

你在1L中贴的第1张图,从贡献百分比上可以看到复合物轨道主要都是A贡献的,而相对应的A的片段轨道能量明显更高。CDA里人为做能级移动的目的是考察轨道混合情况的时候,把两个片段的轨道能级位置调整到接近,便于作图考察,要不然A和B的轨道离得太远不方便看。
sobereva 发表于 Post on 2017-5-29 05:17:30
CDA的结果是直接受到片段状态定义影响的,比如计算键能也是,结果也明显依赖于片段状态的定义影响。定义成什么片段,就应当以什么角度来讨论。当前体系建议用第一种情况的定义,更接近于实际状态中电荷分布,而且此时各个片段都是闭壳层,讨论方便,不用同时看alpha和beta两套数据。

虽然形成共价键时,相位相同和相反会同时出现,但当前体系并不是共价作用,而更接近于展现出来配体的轨道受到Al3+这个显著带正电粒子的影响,使得轨道能级显著降低,顺带着有微量电子转移。
lao7 发表于 Post on 2017-5-28 23:08:41
kekexili_08 发表于 2017-5-28 21:11
第一种情况要做Vshift, 阴离子的能量减个若干电子伏特, 阳离子的加若干电子伏特。

追问一下:我这两种方法计算结果是一致的吗?如果只要移动第一个图的能量。
lao7 发表于 Post on 2017-5-28 21:50:11
kekexili_08 发表于 2017-5-28 21:11
第一种情况要做Vshift, 阴离子的能量减个若干电子伏特, 阳离子的加若干电子伏特。

请问为什么呢?加减多少比较合适呢?规则是什么?谢谢!
kekexili_08 发表于 Post on 2017-5-28 21:11:38
第一种情况要做Vshift, 阴离子的能量减个若干电子伏特, 阳离子的加若干电子伏特。

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