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求助表面羟基化的Al2O3位置限制后最小化不收敛

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sj12138

发布时间: 2026-8-14 19:15

正文摘要:

各位老师好，我使用sobtop生成了表面羟基化的Al2O3的itp，并限制了除表面H外的其他原子的位置随后gmx grompp -f em.mdp -c sys2.gro -o em.tpr -p topol.top -r sys2.gro -maxwarn 1随后mdrun之后一直无法收敛，输出 ...

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sobereva 发表于 Post on 9 hour ago

你用的sobtop产生的拓扑文件怎么可能#include "oplsaa.ff/forcefield.itp"，sobtop产生的拓扑文件完全不兼容OPLS-AA的规则
很可能还有其它硬伤，但起码先把这个解决了再说

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