请教各位老师，COF分层的问题，以及坐标平移问题

正文摘要:

问题1：我在跑COFs吸附小分子的问题，我放了10层COF（因为还有另一组复合COF，考虑比例问题，放10层比较合适），结束之后COF明显分为了3层，如图，这是为什么，应该怎么解决呢 问题2：由于出现了上下跨盒子的情况， ...