计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: 灰飞的旋律
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[硬件] vasp计算40核比28核慢了一大截

[复制链接 Copy URL]

1236

帖子

1

威望

3495

eV
积分
4751

Level 6 (一方通行)

16#
发表于 Post on 2019-5-8 10:29:07 | 只看该作者 Only view this author
灰飞的旋律 发表于 2019-4-30 08:52
如图,很有可能是内存带宽跟不上,node24是2680V4,node26是2673V4,HSE计算DOS,迭代一次LOOP随着核数减 ...

你的内存带宽不够了,四通道双路至少得插8个内存条

200

帖子

0

威望

1501

eV
积分
1701

Level 5 (御坂)

17#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-9 16:45:36 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 灰飞的旋律 于 2019-5-9 16:49 编辑
hakuna 发表于 2019-5-8 10:15
关注2673v4一段时间了,一直觉得应该不错,尤其喜欢它的50MB的cache,刚搜了一下intel官网,竟然没找到这 ...

三级缓存的影响大不大呢,对于VASP计算来说有多大呢??我觉得40核还是太多了,内存带宽可能会有点跟不上,不知道选个32或者36核的但主频更高的,2.6GHz的,比如2690V4,但这样就不如买金牌6132了,毕竟主频都是比2673高0.3,但6132针脚是最新的,以后还可以升级CPU,就是三级缓存少了一半多,不清楚三级缓存和主频 核数 带宽这些因素对VASP计算来说哪几个占主要影响???如果知道的话,就可以挑选一款特别适合vasp计算的又平衡的CPU了

200

帖子

0

威望

1501

eV
积分
1701

Level 5 (御坂)

18#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-9 16:46:00 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 灰飞的旋律 于 2019-5-9 16:47 编辑
biogon 发表于 2019-5-8 10:29
你的内存带宽不够了,四通道双路至少得插8个内存条

我也觉得是,准备插满,我的是ATX主板,只能插8根。那VASP计算是用EATX还是ATX板呢,毕竟前者可以有16个插槽,都插满相对于8插槽能有多大比例提升??

1236

帖子

1

威望

3495

eV
积分
4751

Level 6 (一方通行)

19#
发表于 Post on 2019-5-12 14:19:55 | 只看该作者 Only view this author
灰飞的旋律 发表于 2019-5-9 16:45
三级缓存的影响大不大呢,对于VASP计算来说有多大呢??我觉得40核还是太多了,内存带宽可能会有点跟不上 ...

6132也就能升级白金81xx或者黄金62xx 白金82xx,明年发布的换新接口LGA4189

1236

帖子

1

威望

3495

eV
积分
4751

Level 6 (一方通行)

20#
发表于 Post on 2019-5-12 14:21:12 | 只看该作者 Only view this author
灰飞的旋律 发表于 2019-5-9 16:46
我也觉得是,准备插满,我的是ATX主板,只能插8根。那VASP计算是用EATX还是ATX板呢,毕竟前者可以有16个 ...

够四通道就行,再加多了不能增加性能

200

帖子

0

威望

1501

eV
积分
1701

Level 5 (御坂)

21#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-12 14:45:08 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 灰飞的旋律 于 2019-5-12 14:52 编辑
biogon 发表于 2019-5-12 14:19
6132也就能升级白金81xx或者黄金62xx 白金82xx,明年发布的换新接口LGA4189

LGA4189,这是给啥CPU准备的

1236

帖子

1

威望

3495

eV
积分
4751

Level 6 (一方通行)

22#
发表于 Post on 2019-5-12 20:45:21 | 只看该作者 Only view this author
灰飞的旋律 发表于 2019-5-12 14:45
LGA4189,这是给啥CPU准备的

下一代服务器U

200

帖子

0

威望

1501

eV
积分
1701

Level 5 (御坂)

23#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-31 12:41:36 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 灰飞的旋律 于 2019-5-31 12:44 编辑

又加了四根,总共8根了,够双路四通道了,比原来双路双通道直接减少了40%的耗时。原来NCORE=10,40核用HSE06算DOS一步17222秒,现在10251秒

471

帖子

0

威望

1795

eV
积分
2266

Level 5 (御坂)

24#
发表于 Post on 2019-5-31 19:25:32 | 只看该作者 Only view this author
灰飞的旋律 发表于 2019-5-31 12:41
又加了四根,总共8根了,够双路四通道了,比原来双路双通道直接减少了40%的耗时。原来NCORE=10,40核用HSE06 ...

看来2673v4表现还是可以的

200

帖子

0

威望

1501

eV
积分
1701

Level 5 (御坂)

25#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-31 20:57:34 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 灰飞的旋律 于 2019-5-31 21:10 编辑
hakuna 发表于 2019-5-31 19:25
看来2673v4表现还是可以的

期待明年intel的新CPU架构配合明年新出的DDR5,那带宽,vasp跑GW又可以加速一两倍感觉。外行愚见,欢迎科普,莫喷:啥时候NVM的带宽能跟上来,重要的是延迟也解决了,GW+BSE跑点几十个原子的体系不再是梦。话说NVM越来越成熟了,等用在HPC服务器上,像高斯这种高I/O的,基本上直接可以拿内存当硬盘了,到时候算力也得提升一大截

3

帖子

0

威望

89

eV
积分
92

Level 2 能力者

26#
发表于 Post on 2019-6-14 15:44:36 | 只看该作者 Only view this author
灰飞的旋律 发表于 2019-5-31 12:41
又加了四根,总共8根了,够双路四通道了,比原来双路双通道直接减少了40%的耗时。原来NCORE=10,40核用HSE06 ...

看的就是这个结果。

190

帖子

0

威望

867

eV
积分
1057

Level 4 (黑子)

27#
发表于 Post on 2019-10-9 15:11:45 | 只看该作者 Only view this author
我觉得是核数太多的原因,楼主试下10核,16核的速度

200

帖子

0

威望

1501

eV
积分
1701

Level 5 (御坂)

28#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-9 21:36:50 | 只看该作者 Only view this author
Picardo 发表于 2019-10-9 15:11
我觉得是核数太多的原因,楼主试下10核,16核的速度

已经证实是内存带宽的问题了

1236

帖子

1

威望

3495

eV
积分
4751

Level 6 (一方通行)

29#
发表于 Post on 2020-7-7 18:04:51 | 只看该作者 Only view this author
灰飞的旋律 发表于 2019-5-31 20:57
期待明年intel的新CPU架构配合明年新出的DDR5,那带宽,vasp跑GW又可以加速一两倍感觉。外行愚见,欢迎科 ...

过了一年又翻到这个了,带宽和延迟是不可能都占了好的,NAND颗粒再玩延迟也就那样了,想压缩延迟就是傲腾这种下一代解决方案,还有就是在SSD和DRAM中间折中的傲腾DRAM,有大容量的情况下带宽和延迟也找了个平衡点,当然想用内存或者傲腾当硬盘都需要软件深度优化的,现行的计算软件就别想了,根本用不到那些性能

31

帖子

0

威望

72

eV
积分
103

Level 2 能力者

30#
发表于 Post on 2020-11-17 10:38:05 | 只看该作者 Only view this author
内存是否插满,
这两款CPU基频与全核睿频不一样。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 12:24 , Processed in 0.585544 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list