求助用Ms建模导入gmx原子序号顺序问题

shgpei · 发表于 Post on 2019-7-12 08:33:16

请问用Ms建模生成的结构文件导入gmx，需要写对应的top文件，因为结构中有多种分子，由于结构文件和top文件原子顺序必须一一对应，我之前都是一个个看不同原子序号对应什么分子，在按顺序写在top上，但是体系太大的时候就没办法手动一个一个找了，请问各位老师都是怎么解决的呢？

Emma_Zzz · 发表于 Post on 2019-10-18 10:56:47

请问您这个问题解决了吗

少年爱吃地三鲜 · 发表于 Post on 2019-10-18 14:13:39

看你用什么力场了，有的力场在线生成拓扑，你再检查也可

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[GROMACS] 求助用Ms建模导入gmx原子序号顺序问题