计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 10308|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] Gaussian片段初猜报错

[复制链接 Copy URL]

1187

帖子

5

威望

2876

eV
积分
4163

Level 6 (一方通行)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
首先顺便请问一下,论坛首页那个谷歌镜像的链接是不是挂了,我这边今天用不了了。

我在想乙烷的碳碳键断裂成一个甲基碳正离子+一个甲基碳负离子的电子结构能否找到,就考虑了片段初猜,设置两个片段分别带1个正电和1个负电,然后降低点群从D3d到C3v,对碳碳键键长进行软扫描。
但是刚一开始算就在link 122报错,加了#p后由于出错部分信息没有变化,就不往上贴了。之前看到介绍l122报错可能是片段的电荷或自选多重度设错了,但是我检查了一下没有问题,是我的这个计算想法不可行么?谢谢!

输入文件部分如下:
# opt=modredundant b3lyp/gen guess=(fragment=2,always)
pop=(always,cm5) empiricaldispersion=gd3bj symmetry=pg=c3v

Title Card Required

0 1 1 1 -1 1
C(Fragment=1)      0.00000000    0.00000000    0.49954362
H(Fragment=1)      0.00000000    1.00905043    1.12707501
H(Fragment=1)     -0.87386330   -0.50452521    1.12707501
H(Fragment=1)      0.87386330   -0.50452521    1.12707501
C(Fragment=2)     -0.00000000   -0.00000000   -0.50045638
H(Fragment=2)      0.87344751    0.50428516   -0.85682724
H(Fragment=2)     -0.00000000   -1.00857031   -0.85682724
H(Fragment=2)     -0.87344751    0.50428516   -0.85682724


基组用的ma-SVP,基组部分没有报错就不贴了。

输出文件最后部分如下:
dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =     1 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = F LstWrd =       67072 FType=2 FMxFil=10000

Number              0
Base            40448
End             67072
End1            67072
Wr Pntr         40448
Rd Pntr         40448
Length          26624
Int.Num             1
FileIO operation on non-existent file.
FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=  -584 Len=          24 IPos=           0 Q=        236128864
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.

完整输出文件在附件中

谢谢大家!

ethane_bond_break_ion.gz

4.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

输出文件

4289

帖子

4

威望

9550

eV
积分
13919

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2019-9-21 13:59:06 | 只看该作者 Only view this author
片段初猜只能用来构造初猜,以供随后算单点;无法直接与结构优化、扫描等任务在一个Link里同时实现。

有两种解决方案(1)使用高斯自带的Link分步任务。Link0采用片段初猜(C-C距离较远),Link1开始执行柔性扫描,从C-C远距离往近距离扫描;(2)自己写脚本实现,想算哪个结构算哪个,想批量就批量。
PS:其实没必要如此操作点群,直接写nosymm更省事,你那么写,高斯未必真那么做。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

1187

帖子

5

威望

2876

eV
积分
4163

Level 6 (一方通行)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-9-21 14:19:52 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2019-9-21 13:59
片段初猜只能用来构造初猜,以供随后算单点;无法直接与结构优化、扫描等任务在一个Link里同时实现。

有 ...

好的,我明白了,谢谢您!我写脚本处理一下

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125169

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2019-9-21 17:07:22 | 只看该作者 Only view this author
搜索框没挂
暂时不能用就过阵子再试

用片段初猜明显得不到你期望的那种电子结构,那需要靠约束性DFT
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

1187

帖子

5

威望

2876

eV
积分
4163

Level 6 (一方通行)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-9-21 18:25:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-9-21 17:07
搜索框没挂
暂时不能用就过阵子再试

谢谢老师!那个尝试波函数确实收敛到D3d的样子了。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 04:52 , Processed in 0.165300 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list