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[Amber] MD成品模拟遇到的问题

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请问大家,我在用amber跑MD最后一步的成品模拟时,遇到了以下错误,请大家帮我看一下,是我的体系有什么问题吗?min,heat和proc的输入文件均采用amber官网的例子所使用的参数,后来我把heat部分时间延长了10倍还是未能解决。

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发表于 Post on 2019-10-28 14:46:54 | 只看该作者 Only view this author
heat都不崩溃没有理由prod崩溃
确保prod的时候延续了heat最后一步的坐标和速度,并且prod和heat之间不是必须变化的参数不要进行修改
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发表于 Post on 2019-10-28 17:05:26 | 只看该作者 Only view this author
heat这一步不要用pmemd.cuda, 就用pmemd.mpi 就可以了。

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发表于 Post on 2019-10-28 17:06:28 | 只看该作者 Only view this author
abdoman 发表于 2019-10-28 17:05
heat这一步不要用pmemd.cuda, 就用pmemd.mpi 就可以了。

需要等基本平衡后(密度),就可以用gpu来算prod了。

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发表于 Post on 2019-10-28 20:04:00 | 只看该作者 Only view this author
提示切换到cpu,pmemd.MPI跑了。

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