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[Gaussian/gview] 求助:关于分子力学计算时键型设置的问题

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在分子力学计算输入文件中需要添加geom=connectivity,一开始我用的连接方式就是在gaussview里面自动生成的 1.0 1.5 或者 2.0
后来试着修改了一下单间双键还有芳香键的分布,发现opt和freq后出来的结果并没有改变。
请问这是不是说明在分子力学当中,键的类型的定义不重要,重要的是有无键?(因为力场公式当中也没有对键型的区分?)

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发表于 Post on 2019-11-1 06:57:54 | 只看该作者 Only view this author
很多情况有显著影响,因为会影响原子类型的判断
在gview里打开atom list editor,把原子类型显示出来,你会发现在gview里修改形式键级时判断出的原子类型往往也发生改变
如果你是在gjf里已经明确定义了原子类型了,那形式键级应当就不会产生影响了。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-1 11:01:57 | 只看该作者 Only view this author
嗯,我是自己人工设置成gaff原子类型的。所以键级没有影响。
谢谢sob老师!

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发表于 Post on 2019-12-8 17:26:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-1 06:57
很多情况有显著影响,因为会影响原子类型的判断
在gview里打开atom list editor,把原子类型显示出来,你 ...

卢老师,那在用QM/MM计算的时候,这里给每个原子写入电荷的时候,前面必须带上原子类型么,例如第一个原子我只写C--0.4是不是也是没有问题的。

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发表于 Post on 2019-12-8 18:38:14 | 只看该作者 Only view this author
kay 发表于 2019-12-8 17:26
卢老师,那在用QM/MM计算的时候,这里给每个原子写入电荷的时候,前面必须带上原子类型么,例如第一个原 ...

看用什么力场
AMBER的情况必须指定原子类型,UFF、dreiding不是必需的
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