过渡金属材料用高斯做些啥计算？

Jack_Jun · 发表于 Post on 2020-2-25 22:10:54

尊敬的各位老师
   您们好。
   我是小小白，啥都不知道。刚刚接触量子化学计算这块，前几天在各大高手以及无数网页的帮助下给自己的练习机装上了高斯16，然后导师热情的邀请我计算一个她画出来的二维材料，里面包含过渡态金属M，C, O，现在的问题就是这个分子吧，我首先在  Chimera  里用 amber，识别不了，，说是IDTAM类型错误，后来我直接在VMD里保存为mol2格式，然后用 antechamber -o 那一套生成了gjf，提交任务后就报错  ........................l103
头大！！！
长夜漫漫，我还在努力思考这个问题，我的直觉是要么这个分子的构型本身存在问题，要么是我计算的方向不对，我用的关键词如下：# B3LYP/gen pseudo=read  Pop=MK iop(6/33=2) iop(6/42=6) iop(6/50=1) OPT
然后过渡金属M用的是 lanz 那个赝势，直接从在线的拷贝到gjf后面的

zjxitcc · 发表于 Post on 2020-2-25 22:19:51

我推荐三个选项（1）放弃；（2）找懂的师兄带；（3）去抢报科音的课。
新手不能随便来。给你体系的导师懂计算？不懂计算的老师很容易以为点鼠标做计算，啥概念都没有。还是老老实实先学一些简单的例子吧。

Jack_Jun · 发表于 Post on 2020-2-25 22:29:07

zjxitcc 发表于 2020-2-25 22:19
我推荐三个选项（1）放弃；（2）找懂的师兄带；（3）去抢报科音的课。
新手不能随便来。给你体系的导师懂 ...

嗯，谢谢

Jack_Jun · 发表于 Post on 2020-2-25 22:58:59

Jack_Jun 发表于 2020-2-25 22:29
嗯，谢谢

老子才不会放弃呢！可笑

biogon · 发表于 Post on 2020-2-26 14:13:55

二维材料用高斯简直就是自找不自在，你报错了先把详细信息贴出来啊，你就给这些谁知道为啥
优化甭添加那些多余的关键词

sobereva · 发表于 Post on 2020-2-26 19:23:29

你现在完全连基本计算逻辑都没搞清楚
量化程序本来就不是用来做周期性体系的，除非你把体系挖成团簇模型当孤立体系算
量化计算你用antechamber干嘛，又不是做分子动力学准备拓扑文件
antechamber产生那一堆关键词跟你的计算毫无关系

认真仔细反复阅读此文，否则绝对不可能得到任何有用的数据
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355

Jack_Jun · 发表于 Post on 2020-2-27 19:36:32

sobereva 发表于 2020-2-26 19:23
你现在完全连基本计算逻辑都没搞清楚
量化程序本来就不是用来做周期性体系的，除非你把体系挖成团簇模型当 ...

谢谢老师

薛定谔的老猫 · 发表于 Post on 2020-3-25 21:28:50

zjxitcc 发表于 2020-2-25 22:19
我推荐三个选项（1）放弃；（2）找懂的师兄带；（3）去抢报科音的课。
新手不能随便来。给你体系的导师懂 ...

认为点鼠标的还是不错的，有些麻瓜老师，死要和实验结果强行一致，有毛病的。

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