甲基换成苯环之后始终得不到想要的过渡态求助

tiandikuoyuan · 发表于 Post on 2020-6-13 18:57:33

根据报道的机理（如图，参考网址：https://www.chemtube3d.com/nitrile_oxide_formation/），尝试Gaussian与xtb程序联用搜索过渡态，现在的问题是当我将非反应中心的甲基换成苯环之后始终得不到想要的过渡态，我想请问一下哪里出问题，是过渡态初猜设置的不好吗？简化的机理总共5步都能找到过渡态并做完IRC，所以机理应该没有问题。实验采用的是更大的基团，也存在一定位阻，反应是没有问题的。

ts.zip (1.61 MB, 下载次数 Times of downloads: 3)

hebrewsnabla · 发表于 Post on 2020-6-13 19:05:58

这么小的体系不需要xtb

tiandikuoyuan · 发表于 Post on 2020-6-13 19:54:13

hebrewsnabla 发表于 2020-6-13 19:05
这么小的体系不需要xtb

这只是简化的结构，而且反应步数感觉有点多；就这简化的还摸索了两天

望月凝香 · 发表于 Post on 2020-6-14 05:13:37

苯基会和肟形成共轭，能量、结构变化完全不同。

tiandikuoyuan · 发表于 Post on 2020-6-15 08:59:11

望月凝香发表于 2020-6-14 05:13
苯基会和肟形成共轭，能量、结构变化完全不同。

可以认为换了芳香环之后反应机理变了吗？反应是确实可以发生的

Accelerator · 发表于 Post on 2020-6-15 10:55:47

共轭导致机理变化想太多了
就是找过渡态的努力还不够而已可以通过柔性扫描等方法帮助确定过渡态初始结构

望月凝香 · 发表于 Post on 2020-6-15 11:26:52

tiandikuoyuan 发表于 2020-6-15 08:59
可以认为换了芳香环之后反应机理变了吗？反应是确实可以发生的

可能有alternative mechanism，但是首先尝试别的初始结构。
其中一个重点是芳环和双键的共平面问题。

tiandikuoyuan · 发表于 Post on 2020-6-15 13:54:49

Accelerator 发表于 2020-6-15 10:55
共轭导致机理变化想太多了
就是找过渡态的努力还不够而已可以通过柔性扫描等方法帮助确定过渡态初始结构

谢谢老师建议，我尝试一下柔性扫描

tiandikuoyuan · 发表于 Post on 2020-6-15 13:57:05

望月凝香发表于 2020-6-15 11:26
可能有alternative mechanism，但是首先尝试别的初始结构。
其中一个重点是芳环和双键的共平面问题。

由于苯环上甲基的空间位阻，苯环和双键应该没有办法共平面；我先试下柔性扫描看能不能找到初始结构，自己摆实在是太难了

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[综合交流] 甲基换成苯环之后始终得不到想要的过渡态求助

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