计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 10039|回复 Reply: 7
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Lammps] 求助lammps的dumps命令无法正常执行的问题

[复制链接 Copy URL]

13

帖子

0

威望

153

eV
积分
166

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
我在用以下代码dump出xyz坐标的时候为什么没有out.xyz文件,但是lammps没有报错!units  lj
newton  on
units  lj
newton  on
dimension  3
boundary  p p p
atom_style charge
#box tilt  large

read_data           pencen.data

mass 1 12.011150
mass 2 1.007970

pair_style        reax/c NULL
pair_coeff        * * ffield.reax C H


neighbor            2 bin
neigh_modify            every 1 delay 0 check yes

fix                 1 all qeq/reax 1 0.0 10.0 1e-6 reax/c

timestep        0.05
thermo          10

minimize        1.0e-16 1.0e-8 15000 30000

dump            1 all xyz 1000 dump.xyz

51

帖子

0

威望

1081

eV
积分
1132

Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2020-9-23 12:58:52 | 只看该作者 Only view this author
dump            1 all xyz 1000 dump.xyz ,1000改为1
专注于面向个人的量化问题解决,LAMMPS ReaxFF力场。一对一提供服务,本人个人电脑提供计算资源,双路8168,128G内存。

13

帖子

0

威望

153

eV
积分
166

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-23 14:54:00 | 只看该作者 Only view this author
447951397 发表于 2020-9-23 12:58
dump            1 all xyz 1000 dump.xyz ,1000改为1

一样的,我改过,也没法输出,谢谢回复

51

帖子

0

威望

1081

eV
积分
1132

Level 4 (黑子)

4#
发表于 Post on 2020-9-23 19:36:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 447951397 于 2020-9-23 20:02 编辑
江湖采花贼 发表于 2020-9-23 14:54
一样的,我改过,也没法输出,谢谢回复

minimize    sd     1.0e-16 1.0e-8 15000 30000
专注于面向个人的量化问题解决,LAMMPS ReaxFF力场。一对一提供服务,本人个人电脑提供计算资源,双路8168,128G内存。

13

帖子

0

威望

153

eV
积分
166

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-23 20:38:42 | 只看该作者 Only view this author
447951397 发表于 2020-9-23 19:36
minimize    sd     1.0e-16 1.0e-8 15000 30000

ERROR: Illegal minimize command (../minimize.cpp:33)
Last command: minimize        sd     1.0e-16 1.0e-8 15000 30000

51

帖子

0

威望

1081

eV
积分
1132

Level 4 (黑子)

6#
发表于 Post on 2020-9-24 08:18:33 | 只看该作者 Only view this author
江湖采花贼 发表于 2020-9-23 20:38
ERROR: Illegal minimize command (../minimize.cpp:33)
Last command: minimize        sd     1.0e-16 ...

minimize命令下添加
min_style sd
专注于面向个人的量化问题解决,LAMMPS ReaxFF力场。一对一提供服务,本人个人电脑提供计算资源,双路8168,128G内存。

30

帖子

0

威望

1278

eV
积分
1308

Level 4 (黑子)

7#
发表于 Post on 2020-9-24 09:31:49 | 只看该作者 Only view this author
把dump那行写到minmize上面去

13

帖子

0

威望

153

eV
积分
166

Level 3 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-24 10:04:24 | 只看该作者 Only view this author
dazhong_jl 发表于 2020-9-24 09:31
把dump那行写到minmize上面去

解决了,谢谢您,这是为啥呢,lammps输出还跟命令顺序有关吗,

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-22 06:50 , Processed in 0.153857 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list