VMD中表面着色，color scale怎么使用eV的数值？

nunup5 · 发表于 Post on 2015-12-9 17:36:05

按着sob老师的教程《使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布》作图，由于所做的体系，静电势用kcal/mol表示，数值太大，不容易分辨，作图也不美观，想用eV的数值表示，可是在VMD中着色分子表面默认的就是kcal/mol的数值，这个可以修改吗？谢谢大家！

nunup5 · 发表于 Post on 2015-12-9 17:40:41

直接换算是可以，可是color bar就没办法取整了。哎呀，我好纠结！

sobereva · 发表于 Post on 2015-12-9 18:21:23

color bar自行ps一下就行，用不着每个刻度都给出来，就把最大值、最小值以及零点的位置标注上去就行。
用kcal/mol作为单位是必须的，因为pdb个B因子的格式记录精度很有限。

清微 · 发表于 Post on 2017-7-17 20:22:47

sobereva 发表于 2015-12-9 18:21
color bar自行ps一下就行，用不着每个刻度都给出来，就把最大值、最小值以及零点的位置标注上去就行。
用k ...

老师，作color-filled map时，lower&upper limit of color scale默认值为-0.1到0.1，当调为0到0.001时，color bar不显示刻度了，有没有办法让其显示呢？

sobereva · 发表于 Post on 2017-7-18 00:19:58

清微发表于 2017-7-17 20:22
老师，作color-filled map时，lower&upper limit of color scale默认值为-0.1到0.1，当调为0到0.001时，c ...

这没办法，可以导出平面数据再用sigmaplot等重新绘制，这时候刻度可以随意调节

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