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[Multiwfn使用咨询] VMD中表面着色,color scale怎么使用eV的数值?

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发表于 2015-12-9 17:36:05 | 显示全部楼层 |阅读模式
按着sob老师的教程《使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布》作图,由于所做的体系,静电势用kcal/mol表示,数值太大,不容易分辨,作图也不美观,想用eV的数值表示,可是在VMD中着色分子表面默认的就是kcal/mol的数值,这个可以修改吗?谢谢大家!

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 楼主| 发表于 2015-12-9 17:40:41 | 显示全部楼层
直接换算是可以,可是color bar就没办法取整了。哎呀,我好纠结!

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发表于 2015-12-9 18:21:23 | 显示全部楼层
color bar自行ps一下就行,用不着每个刻度都给出来,就把最大值、最小值以及零点的位置标注上去就行。
用kcal/mol作为单位是必须的,因为pdb个B因子的格式记录精度很有限。
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发表于 2017-7-17 20:22:47 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2015-12-9 18:21
color bar自行ps一下就行,用不着每个刻度都给出来,就把最大值、最小值以及零点的位置标注上去就行。
用k ...

老师,作color-filled map时,lower&upper limit of color scale默认值为-0.1到0.1,当调为0到0.001时,color bar不显示刻度了,有没有办法让其显示呢?

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发表于 7 天前 | 显示全部楼层
清微 发表于 2017-7-17 20:22
老师,作color-filled map时,lower&upper limit of color scale默认值为-0.1到0.1,当调为0到0.001时,c ...

这没办法,可以导出平面数据再用sigmaplot等重新绘制,这时候刻度可以随意调节
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