QM/MM方法优化中心分子构型时，输出文件拖入gaussview中发现有多个分子构型

liuyuqi · 发表于 Post on 2021-11-25 17:03:50

本帖最后由 liuyuqi 于 2021-11-28 15:59 编辑

在使用QM/MM方法优化中心分子构型时，输出文件（正常结束）拖入gaussview中，发现结果由多个结构组成，如下图所示。

但是我用ultra edit打开输出文件，发现里面的stationary point只有一个，也就是最后一步（第25步）的那个点，所以我不知道，是我Gaussview设置的问题还是什么别的问题。并且我不知道应该基于哪一个构型来做之后的一系列运算。希望各位老师可以指点一二，多谢！

kay · 发表于 Post on 2021-11-26 08:32:37

你说的多个构型，是优化不同能量的结构，最后才是极小点，用最后的结构。

liuyuqi · 发表于 Post on 2021-11-26 10:45:12

kay 发表于 2021-11-26 08:32
你说的多个构型，是优化不同能量的结构，最后才是极小点，用最后的结构。

好的，多谢

sobereva · 发表于 Post on 2021-11-26 11:20:50

Gaussian不支持QMMM，分清楚ONIOM(QM:MM)和QMMM的区别，思想上完全不同

liuyuqi · 发表于 Post on 2021-11-28 15:59:13

sobereva 发表于 2021-11-26 11:20
Gaussian不支持QMMM，分清楚ONIOM(QM:MM)和QMMM的区别，思想上完全不同

好的老师，我明白了，以后会好好区分开的

SunYiiiiiT · 发表于 Post on 2023-10-23 22:30:40

请问您知道QM/MM模型中做晶体环境中的结构优化怎么做吗？想做一个和这篇文献中一样的计算。 https://doi.org/10.1021/jacs.3c08164

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[新手求助] QM/MM方法优化中心分子构型时，输出文件拖入gaussview中发现有多个分子构型