计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 4201|回复 Reply: 10
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 求助:cp2k的restart文件为什么不是最后一步的结果

[复制链接 Copy URL]

30

帖子

0

威望

348

eV
积分
378

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
如题,想用cp2k restarat文件续算,但发现restart文件非实时更新。CP2K每500步会产生一个restart文件,然后从第1000步开始会额外有一个restart文件,此文件会和500步整数倍的restart文件同步更新,并非最后一步的restart文件。
也就是说,假如一个算例跑了2200步,会产生5个restart文件,最新的那个restart文件和第2000步的restart文件是一样的,如果使用该resart文件续算,ener文件内容是不连续的,从2200步接着是2001步,轨迹文件也是相应重复了一小部分,求教如何解决,谢谢。

205

帖子

3

威望

1894

eV
积分
2159

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2022-3-10 14:58:52 | 只看该作者 Only view this author
通过更改
      &EACH
        MD 10 #Frequency of updating last restart file
字段控制restart文件的更新频率,10是每500步输出一次,社长multiwfn产生的输入文件后面都带注释了,如果不是multiwfn产生的文件,为啥不去翻手册呢

另外,你可以手动删掉重复的轨迹

42

帖子

0

威望

926

eV
积分
968

Level 4 (黑子)

3#
发表于 Post on 2022-3-10 21:12:08 | 只看该作者 Only view this author
这里也有个问题想要问一下各位老师,重新开始运算时的前几步的能量会明显的高于之前的同一轨迹的能量,这个该怎么取舍呢

30

帖子

0

威望

348

eV
积分
378

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-11 16:49:39 | 只看该作者 Only view this author
Eudaimonia 发表于 2022-3-10 14:58
通过更改
      &EACH
        MD 10 #Frequency of updating last restart file

谢谢。慌乱的新手不知道还有这种参数来控制,还以为是固定的。

30

帖子

0

威望

348

eV
积分
378

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-11 16:50:16 | 只看该作者 Only view this author
asd9998876 发表于 2022-3-10 21:12
这里也有个问题想要问一下各位老师,重新开始运算时的前几步的能量会明显的高于之前的同一轨迹的能量,这个 ...

这个我也遇到了,同问

977

帖子

0

威望

1929

eV
积分
2906

Level 5 (御坂)

偽語言學家+註冊摸魚師

6#
发表于 Post on 2022-10-3 17:42:31 | 只看该作者 Only view this author
Eudaimonia 发表于 2022-3-10 14:58
通过更改
      &EACH
        MD 10 #Frequency of updating last restart file

请问这个MD的参数与restart文件的更新频率有什么对应关系,我在CP2K官网手册上查不到。
ORCA大法好!算得快,还免费,我爷爷的爷爷都说不赖!
山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔᵊ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ。

205

帖子

3

威望

1894

eV
积分
2159

Level 5 (御坂)

7#
发表于 Post on 2022-10-3 19:45:02 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-10-3 17:42
请问这个MD的参数与restart文件的更新频率有什么对应关系,我在CP2K官网手册上查不到。

我也不确定有什么对应关系

@jiangjiangna  他可能做过测试,请问有什么对应关系吗?

42

帖子

0

威望

926

eV
积分
968

Level 4 (黑子)

8#
发表于 Post on 2022-10-3 22:06:57 | 只看该作者 Only view this author
默认最低是500步一次,10,5,20都是500步,之后的就是1000就是1000步存一次,2000就是2000步存一次,并没有那么多弯弯绕绕

轨迹文件的重复可以手动删去

977

帖子

0

威望

1929

eV
积分
2906

Level 5 (御坂)

偽語言學家+註冊摸魚師

9#
发表于 Post on 2022-10-3 22:33:48 | 只看该作者 Only view this author
asd9998876 发表于 2022-10-3 22:06
默认最低是500步一次,10,5,20都是500步,之后的就是1000就是1000步存一次,2000就是2000步存一次,并没有 ...

好的,谢谢!
ORCA大法好!算得快,还免费,我爷爷的爷爷都说不赖!
山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔᵊ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ。

1

帖子

0

威望

147

eV
积分
148

Level 2 能力者

10#
发表于 Post on 2022-10-14 15:47:43 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 jiangjiangna 于 2022-10-14 15:50 编辑

我测试过了,后来下载最新版的Multiwfn去生成输入文件,打开输入文件自己去设置的Each,数字填几就是每几步生成一次restart文件,不再遵循旧版本最低500步才更新。@Eudaimonia,@chands

38

帖子

0

威望

437

eV
积分
475

Level 3 能力者

11#
发表于 Post on 2024-10-19 14:42:50 | 只看该作者 Only view this author
Eudaimonia 发表于 2022-3-10 14:58
通过更改
      &EACH
        MD 10 #Frequency of updating last restart file

请问下最低只能设置500步输出一次吗

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 09:58 , Processed in 0.221120 second(s), 27 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list