如何使用reaxff计算键能解离过程

lc123 · 发表于 Post on 2022-3-26 09:37:01

大家好，最近有看到使用reaxff和DFT做对比计算势能曲线，就是计算出不同键长对应的能量，DFT的话可以通过柔性扫描得到，请教大家如何用reaxff的话应该怎么进行计算呢，类似于下面这张图片所失曲线

谢谢大家！

sobereva · 发表于 Post on 2022-3-26 14:29:31

未必做了柔性扫描，也可能只是刚性扫描

如果确实是基于柔性扫描做的，用ReaxFF对其它某个级别的柔性扫描轨迹每一帧算能量就完了，怎么做看具体程序

lc123 · 发表于 Post on 2022-3-26 15:29:28

sobereva 发表于 2022-3-26 14:29
未必做了柔性扫描，也可能只是刚性扫描

如果确实是基于柔性扫描做的，用ReaxFF对其它某个级别的柔性扫描 ...

谢谢老师的解答，但是我对老师您所说的用Reaxff对其他某个级别的柔性扫描轨迹每一帧算能量没太理解，老师您的意思是说把柔性扫描的每一帧轨迹视为一个初始结构，然后用reaxff计算这些个结构的能量吗？（老师我用的是lammps里面的reaxff力场，那这些都是在lammps里面计算吗）

sobereva · 发表于 Post on 2022-3-26 16:39:50

lc123 发表于 2022-3-26 15:29
谢谢老师的解答，但是我对老师您所说的用Reaxff对其他某个级别的柔性扫描轨迹每一帧算能量没太理解，老师 ...

是

mengxiangidea · 发表于 Post on 2022-3-28 20:36:19

楼主你好，请问你反应力场参数如何选取的，可以私下请教一些问题吗

lc123 · 发表于 Post on 2022-3-30 20:08:29

mengxiangidea 发表于 2022-3-28 20:36
楼主你好，请问你反应力场参数如何选取的，可以私下请教一些问题吗

可以的啊，是从别人的文献中引用的

mengxiangidea · 发表于 Post on 2022-3-31 21:30:50

lc123 发表于 2022-3-30 20:08
可以的啊，是从别人的文献中引用的

能加qq吗？qq：794398844

mengxiangidea · 发表于 Post on 2022-3-31 22:34:03

mengxiangidea 发表于 2022-3-31 21:30
能加qq吗？qq：794398844

我想知道param.qeq文件里面坐标怎么来的

ZZU_SCU · 发表于 Post on 2022-4-3 21:31:37

lc123 发表于 2022-3-26 15:29
谢谢老师的解答，但是我对老师您所说的用Reaxff对其他某个级别的柔性扫描轨迹每一帧算能量没太理解，老师 ...

您好！我也想做这样的解离曲线，怎么把DFT柔性或者刚性扫描的每一帧保存成trj轨迹文件。lammps怎么写脚本依次识别每一帧呢？

lc123 · 发表于 Post on 2022-4-12 13:51:50

ZZU_SCU 发表于 2022-4-3 21:31
您好！我也想做这样的解离曲线，怎么把DFT柔性或者刚性扫描的每一帧保存成trj轨迹文件。lammps怎么写脚本 ...

不好意思啊这个lammps脚本怎么写我也不太会，后来我导师没让我继续这方面的研究了，我的理解是把柔性扫描出的每一步结构都单独保存下来，改写成lammps的data文件，然后用lammps分别计算这些结构的能量，但是感觉有点繁琐。

ZZU_SCU · 发表于 Post on 2022-4-12 15:17:02

lc123 发表于 2022-4-12 13:51
不好意思啊这个lammps脚本怎么写我也不太会，后来我导师没让我继续这方面的研究了，我的理解是把柔性扫描 ...

谢谢您的回复，我也是这样做的。感觉有些繁琐

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[综合交流] 如何使用reaxff计算键能解离过程