求教Operation on file out of range 该如何解决？

节奏旅行家

楼主是本科生做毕业论文（计算化学方向），才接触一个月，一问师兄师姐也不知道怎么解决，二问导师让我自己查文献上网问，真是不知怎么办了
所以来求教一下各位，这个问题该怎么解决？

部分log文件：
---------------------------------------------------------------------
Rotational constants (GHZ):***************    298.8275879    298.8198479
Leave Link  202 at Thu Mar 17 21:06:22 2016, MaxMem=  1610612736 cpu:         0.3
(Enter /public/home/herx/hrx/g09/l301.exe)
Standard basis: CC-pVTZ (5D, 7F)
Ernie: Thresh=  0.10000D-02 Tol=  0.10000D-05 Strict=F.
Ernie:  15 primitive shells out of 154 were deleted.
RepNN0:  I=     3 J=     2 R= 2.29D-16
RepNN0:  I=     4 J=     2 R= 3.39D-16
RepNN0:  I=     4 J=     3 R= 1.39D-16
RepNN0:  I=     5 J=     2 R= 5.82D-16
RepNN0:  I=     5 J=     3 R= 3.55D-16
RepNN0:  I=     5 J=     4 R= 2.61D-16
RepNN0:  I=     7 J=     2 R= 5.79D-16
RepNN0:  I=     7 J=     3 R= 7.99D-16
RepNN0:  I=     7 J=     4 R= 9.18D-16
RepNN0:  I=     7 J=     5 R= 1.15D-15
RepNN0:  I=     8 J=     2 R= 4.73D-16
RepNN0:  I=     8 J=     3 R= 6.99D-16
RepNN0:  I=     8 J=     4 R= 8.11D-16
RepNN0:  I=     8 J=     5 R= 1.05D-15
RepNN0:  I=     8 J=     7 R= 1.25D-16
There are   146 symmetry adapted cartesian basis functions of A'  symmetry.
There are    74 symmetry adapted cartesian basis functions of A"  symmetry.
There are   124 symmetry adapted basis functions of A'  symmetry.
There are    68 symmetry adapted basis functions of A"  symmetry.
   192 basis functions,   311 primitive gaussians,   220 cartesian basis functions
    17 alpha electrons       17 beta electrons
       nuclear repulsion energy********************* Hartrees.
IExCor=  402 DFT=T Ex+Corr=B3LYP ExCW=0 ScaHFX=  0.200000
ScaDFX=  0.800000  0.720000  1.000000  0.810000 ScalE2=  1.000000  1.000000
IRadAn=      0 IRanWt=     -1 IRanGd=            0 ICorTp=0 IEmpDi=  4
NAtoms=    8 NActive=    8 NUniq=    7 SFac= 1.31D+00 NAtFMM=   60 NAOKFM=F Big=F
Integral buffers will be    131072 words long.
Regular integral format.
Two-electron integral symmetry is turned on.
Leave Link  301 at Thu Mar 17 21:06:23 2016, MaxMem=  1610612736 cpu:         1.4
(Enter /public/home/herx/hrx/g09/l302.exe)
NPDir=0 NMtPBC=     1 NCelOv=     1 NCel=       1 NClECP=     1 NCelD=      1
         NCelK=      1 NCelE2=     1 NClLst=     1 CellRange=     0.0.
One-electron integrals computed using PRISM.
One-electron integral symmetry used in STVInt
Error in orthogonal basis= 8.02D-01 with    99 functions, increasing threshold to 2.00D-06.
Error in orthogonal basis= 8.02D-01 with    99 functions, increasing threshold to 4.00D-06.
Error in orthogonal basis= 8.02D-01 with    97 functions, increasing threshold to 8.00D-06.
Error in orthogonal basis= 8.02D-01 with    97 functions, increasing threshold to 1.60D-05.
Error in orthogonal basis= 8.02D-01 with    93 functions, increasing threshold to 3.20D-05.
Error in orthogonal basis= 8.02D-01 with    89 functions, increasing threshold to 6.40D-05.
Error in orthogonal basis= 8.02D-01 with    88 functions, increasing threshold to 1.28D-04.
Error in orthogonal basis= 8.02D-01 with    82 functions, increasing threshold to 2.56D-04.
Error in orthogonal basis= 5.61D-01 with    81 functions, increasing threshold to 5.12D-04.
Error in orthogonal basis= 5.61D-01 with    76 functions, increasing threshold to 1.02D-03.
Error in orthogonal basis= 5.61D-01 with    73 functions, increasing threshold to 2.05D-03.
Error in orthogonal basis= 5.61D-01 with    73 functions, increasing threshold to 4.10D-03.
Error in orthogonal basis= 5.61D-01 with    72 functions, increasing threshold to 8.19D-03.
Error in orthogonal basis= 5.61D-01 with    68 functions, increasing threshold to 1.64D-02.
Error in orthogonal basis= 5.61D-01 with    68 functions, increasing threshold to 3.28D-02.
Error in orthogonal basis= 5.61D-01 with    63 functions, increasing threshold to 6.55D-02.
Error in orthogonal basis= 5.61D-01 with    59 functions, increasing threshold to 1.31D-01.
Error in orthogonal basis= 5.61D-01 with    55 functions, increasing threshold to 2.62D-01.
Error in orthogonal basis= 5.61D-01 with    43 functions, increasing threshold to 5.24D-01.
Error in orthogonal basis= 5.61D-01 with    39 functions, increasing threshold to 1.05D+00.
Error in orthogonal basis= 5.61D-01 with    38 functions, increasing threshold to 2.10D+00.
Error in orthogonal basis= 3.43D-01 with    27 functions, increasing threshold to 4.19D+00.
Error in orthogonal basis= 7.60D-02 with    20 functions, increasing threshold to 8.39D+00.
Error in orthogonal basis= 5.46D-02 with     9 functions, increasing threshold to 1.68D+01.
NBasis=   192 RedAO= T EigKep=  1.68D+01  NBF=   124    68
NBsUse=     3 1.68D+01 EigRej=  1.65D+01 NBFU=     3     0
Precomputing XC quadrature grid using
IXCGrd= 4 IRadAn=           0 IRanWt=          -1 IRanGd=           0 AccXCQ= 0.00D+00.
Generated NRdTot=       0 NPtTot=           0 NUsed=           0 NTot=          32
NSgBfM=   220   220   220   220   220 MxSgAt=     8 MxSgA2=     8.
Leave Link  302 at Thu Mar 17 21:06:24 2016, MaxMem=  1610612736 cpu:        11.3
(Enter /public/home/herx/hrx/g09/l308.exe)
Leave Link  308 at Thu Mar 17 21:06:24 2016, MaxMem=  1610612736 cpu:         1.1
(Enter /public/home/herx/hrx/g09/l303.exe)
DipDrv:  MaxL=1.
Leave Link  303 at Thu Mar 17 21:06:24 2016, MaxMem=  1610612736 cpu:         0.9
(Enter /public/home/herx/hrx/g09/l401.exe)
Initial guess from the checkpoint file:  "H2C3H-N2-C1s1opt.chk"
B after Tr=     0.000000    0.000000    0.100434
         Rot=    0.528602   -0.469660    0.528602    0.469660 Ang=-116.18 deg.
Guess basis will be translated and rotated to current coordinates.
Operation on file out of range.
FileIO: IOper= 1 IFilNo(1)=-19997 Len=          15 IPos=           0 Q=   47114992318600


dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles =    97 SizExt =    524288 WInBlk =      4096
                   defal = T LstWrd =     6971392 FType=2 FMxFil=10000

Number              0             0             0             0             0             0
Base          2235545       1247428       2314240       2420736       1808870        512000
End           2236416       1249280       2363392       2488128       2130711        548864
End1          2236416       1249280       2363392       2488128       2130711        548864
Wr Pntr       2235545       1247428       2252800       2420736       1808870        512000
Rd Pntr       2235545       1247428       2252800       2420736       1808870        512000
Length            871          1852         49152         67392        321841         36864

Number              0             0             0             0             0             0
Base          1069056        868352        344064        258048       1290240        323584
End           1228800        872448        348160        270336       1347584        327680
End1          1228800        872448        348160        270336       1347584        327680
Wr Pntr       1069056        868352        344064        258048       1290240        323584
Rd Pntr       1069056        868352        344064        258048       1290240        323584
Length         159744          4096          4096         12288         57344          4096

Number              0             0             0           501           502           503
Base           229376        884736       2526979         65536        102400        221184
End            233472        888832       6971392         66536        106793        221241
End1           233472        888832       6971392         69632        110592        225280
Wr Pntr        229376        884736       2526979         65536        102400        221184
Rd Pntr        229376        884736       2526979         65536        102400        221184
Length           4096          4096       4444413          1000          4393            57

Number            508           511           514           515           516           517
Base           352256        245760        491520        413696        356352        835584
End            352286        246197        510048        487808        411936        837120
End1           356352        249856        512000        491520        413696        839680
Wr Pntr        352256        245760        491520        413696        356352        835584
Rd Pntr        352256        245760        491520        413696        356352        835584
Length             30           437         18528         74112         55584          1536

Number            518           520           521           522           523           524
Base           778240        339968        290816       2252800        839680        888832
End            833824        339978        290851       2252803        840064        925696
End1           835584        344064        294912       2256896        843776        925696
Wr Pntr        778240        339968        290816       2252803        839680        888832
Rd Pntr        778240        339968        290816       2252800        839680        888832
Length          55584            10            35             3           384         36864

Number            526           528           530           532           534           536
Base           970752        925696        847872        950272       1007616       1028096
End           1007616        944224        866400        968800       1026144       1046624
End1          1007616        946176        868352        970752       1028096       1048576
Wr Pntr        970752        925696        847872        950272       1007616       1046624
Rd Pntr        970752        925696        847872        950272       1007616       1028096
Length          36864         18528         18528         18528         18528         18528

Number            538           545           547           548           551           552
Base          1048576        876544        843776       1249280        274432        315392
End           1067104        876572        844160       1285184        274470        315436
End1          1069056        880640        847872       1286144        278528        319488
Wr Pntr       1067104        876544        843776       1249280        274432        315392
Rd Pntr       1048576        876544        843776       1249280        274470        315392
Length          18528            28           384         35904            38            44

Number            559           561           562           563           565           569
Base           307200        278528       2236416        946176       2367488        872448
End            307202        278529       2242576        946368       2367760        872450
End1           311296        282624       2244608        950272       2371584        876544
Wr Pntr        307200        278528       2236416        946176       2367488        872448
Rd Pntr        307200        278528       2242576        946176       2367488        872448
Length              2             1          6160           192           272             2

Number            571           572           575           577           579           580
Base          1228800        552960        237568        319488        270336        299008
End           1247328        775296        244679        319540        270352        299832
End1          1247328        778240        245760        323584        274432        303104
Wr Pntr       1228800        552960        237568        319488        270336        299008
Rd Pntr       1228800        552960        237568        319540        270336        299008
Length          18528        222336          7111            52            16           824

Number            581           582           583           584           598           603
Base           303104       2363392        311296        327680        110592       2371584
End            304000       2363968        311305        327728        110594       2371585
End1           307200       2367488        315392        331776        114688       2375680
Wr Pntr        303104       2363392        311296        327680        110592       2371584
Rd Pntr        303104       2363392        311296        327680        110592       2371584
Length            896           576             9            48             2             1

Number            605           606           607           619           631           633
Base          2244608       2260992        880640        331776       2130711       1347584
End           2244609       2260995        880827        332981       2198489       1808870
End1          2248704       2265088        884736        335872       2198489       1808870
Wr Pntr       2244608       2260995        880640        331776       2130711       1347584
Rd Pntr       2244608       2260992        880640        331776       2130711       1347584
Length              1             3           187          1205         67778        461286

Number            634           635           655           659           665           670
Base          2488128       2375680       2198489       2217017        225280        294912
End           2526979       2417697       2217017       2235545        225536        296281
End1          2526979       2420736       2217017       2235545        229376        299008
Wr Pntr       2488128       2375680       2198489       2217017        225280        294912
Rd Pntr       2488128       2375680       2198489       2217017        225280        296281
Length          38851         42017         18528         18528           256          1369

Number            674           685           694           695           698           701
Base           233472       2248704       1286144        335872        286720        249856
End            233576       2249280       1286518        336148        286768        254865
End1           237568       2252800       1290240        339968        290816        258048
Wr Pntr        233472       2248704       1286144        335872        286720        249856
Rd Pntr        233472       2249280       1286144        335872        286720        249856
Length            104           576           374           276            48          5009

Number            742           761           770           783           989           991
Base           548864        282624       1247328        348160         69632         94208
End            548896        282625       1247428        350626         89632        100770
End1           552960        286720       1247428        352256         90112        102400
Wr Pntr        548864        282624       1247328        348160         69632         94208
Rd Pntr        548864        282624       1247328        348160         69632        100770
Length             32             1           100          2466         20000          6562

Number            992           993           994           995           996           997
Base            90112         61440         40960         57344         49152         53248
End             90121         61640         40990         57364         49352         53466
End1            94208         65536         45056         61440         53248         57344
Wr Pntr         90112         61440         40960         57344         49152         53248
Rd Pntr         90121         61640         40990         57364         49352         53466
Length              9           200            30            20           200           218

Number            998           999          2551          2556          9997          9998
Base            45056        114688       2256896       2265088       2310144       2306048
End             45256        217192       2257472       2265664       2310153       2306057
End1            49152        221184       2260992       2269184       2314240       2310144
Wr Pntr         45056        114688       2257472       2265664       2310144       2306048
Rd Pntr         45256        117192       2257472       2265664       2310144       2306048
Length            200        102504           576           576             9             9

Number           9999
Base          2269184
End           2306048
End1          2306048
Wr Pntr       2306048
Rd Pntr       2270144
Length          36864


dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles =    57 SizExt =         0 WInBlk =      4096
                   defal = F LstWrd =     1146880 FType=2 FMxFil=10000

Number              0             0             0           501           502           503
Base           196556        438003       1144152        285513        286513       1022765
End            285513        493597       1146880        286513        290906       1022822
End1           285513        493597       1146880        286513        290906       1022822
Wr Pntr        196556        438003       1144152        285513        286513       1022765
Rd Pntr        196556        438003       1144152        285513        286513       1022765
Length          88957         55594          2728          1000          4393            57

Number            508           511           520           521           522           524
Base            40960        292275        319907        327103         41190        327166
End             40990        292712        319917        327138         41574        364030
End1            40990        292712        319917        327138         41574        364030
Wr Pntr         40960        292275        319907        327103         41190        327166
Rd Pntr         40960        292275        319907        327103         41574        364030
Length             30           437            10            35           384         36864

Number            526           528           530           532           534           536
Base           364030       1029380       1047908       1066436       1084964         80425
End            400894       1047908       1066436       1084964       1103492         98953
End1           400894       1047908       1066436       1084964       1103492         98953
Wr Pntr        364030       1029380       1047908       1066436       1084964         80425
Rd Pntr        364030       1029380       1047908       1066436       1084964         98953
Length          36864         18528         18528         18528         18528         18528

Number            538           545           548           551           552           561
Base            98953        327138        400894        319952        319917        313710
End            117481        327166        436798        319990        319952        313711
End1           117481        327166        436798        319990        319952        313711
Wr Pntr         98953        327138        400894        319952        319917        313710
Rd Pntr        117481        327138        400894        319952        319917        313710
Length          18528            28         35904            38            35             1

Number            562           563           565           569           575           577
Base           313711       1103492       1103684        319990        319992        319855
End            319855       1103684       1103820        319992        327103        319907
End1           319855       1103684       1103820        319992        327103        319907
Wr Pntr        313711       1103492       1103684        319990        319992        319855
Rd Pntr        313711       1103492       1103684        319990        319992        319855
Length           6144           192           136             2          7111            52

Number            579           580           581           582           583           584
Base          1028540       1028556       1103820       1104716       1105292        292968
End           1028556       1029380       1104716       1105292       1105301        293016
End1          1028556       1029380       1104716       1105292       1105301        293016
Wr Pntr       1028540       1028556       1103820       1104716       1105292        292968
Rd Pntr       1028540       1028556       1103820       1104716       1105292        292968
Length             16           824           896           576             9            48

Number            603           605           607           619           631           633
Base           159499        159498       1027979        436798        954883        493597
End            196556        159499       1028166        438003       1022661        954883
End1           196556        159499       1028166        438003       1022661        954883
Wr Pntr        159499        159498       1027979        436798        954883        493597
Rd Pntr        159499        159498       1027979        436798        954883        493597
Length          37057             1           187          1205         67778        461286

Number            634           635           665           670           674           694
Base            41574        117481        292712        290906       1022661       1028166
End             80425        159498        292968        292275       1022765       1028540
End1            80425        159498        292968        292275       1022765       1028540
Wr Pntr         41574        117481        292712        290906       1022661       1028166
Rd Pntr         41574        117481        292712        292275       1022661       1028166
Length          38851         42017           256          1369           104           374

Number            695           698           701           770           780           989
Base           293016       1022822       1022870       1027879       1105301        293292
End            293292       1022870       1027879       1027979       1144152        313292
End1           293292       1022870       1027879       1027979       1144152        313292
Wr Pntr        293016       1022822       1022870       1027879       1105301        293292
Rd Pntr        293016       1022822       1022870       1027879       1105301        293292
Length            276            48          5009           100         38851         20000

Number            993           997           998
Base           313292        313492         40990
End            313492        313710         41190
End1           313492        313710         41190
Wr Pntr        313292        313492         40990
Rd Pntr        313292        313710         41190
Length            200           218           200


dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =     1 SizExt =    524288 WInBlk =      4096
                   defal = T LstWrd =       65536 FType=2 FMxFil=10000

Number              0
Base            40960
End             65536
End1            65536
Wr Pntr         40960
Rd Pntr         40960
Length          24576
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.

节奏旅行家

查到个这个，还是不太懂什么意思
Operation on file out of range

Description of Error
At the end of your output, you get a line such as
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.
Above this, you have something like
Operation on file out of range.
FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=-19999 Len=     1829888 IPos=  -900525056 Q=       4352094416


dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles =   109 SizExt =    524288 WInBlk =      1024
                   defal = T LstWrd =  7437256704 FType=2 FMxFil=10000
... a lot of numbers
Explanation of Error
This typically happens when you try to retrieve something from the checkpoint file (Opt=ReadFC or guess=read or geom=allcheck/modify) that is not there, either because you did not calculate it previously, or you ran out of disk space/time in the middle of a job and the information needed wasn't written to the checkpoint file.
Fixing the Error
Don't ask for the information in the checkpoint file (i.e. re-calculate or type in what you need)

sobereva

从nuclear repulsion energy为******来看，8成是你的结构不合理，输入文件传上来一看就清楚了

节奏旅行家

sobereva 发表于 2016-3-19 17:35
从nuclear repulsion energy为******来看，8成是你的结构不合理，输入文件传上来一看就清楚了

您好！这是我的输入文件：

%chk=H2C3H-N2-C1s1opt.chk
%mem=20GB
%nprocshared=20
#p td=(nstates=5,root=1) b3lyp/cc-pVTZ  scf(maxcyc=400,conver=8)  iop(2/16=2,2/17=2)  opt=gdiis

H2C3H-N2-C1s1opt

1 1
H                  0.08923000    0.25289200    0.93407900
C                  0.00000000    0.81392600    0.00000000
C                 -0.14723900    2.14066200    0.00000000
C                 -0.28583000    3.40018000    0.00000000
H                 -0.39596600    4.46813500    0.00000000
H                  0.08923000    0.25289200   -0.93407900
N                  0.22077800   -3.62388200    0.00000000
N                  0.18149600   -2.53362200    0.00000000

sobereva

节奏旅行家 发表于 2016-3-20 20:38
您好！这是我的输入文件：

%chk=H2C3H-N2-C1s1opt.chk

把scf(maxcyc=400,conver=8)  iop(2/16=2,2/17=2)都去掉重新算再试

节奏旅行家

sobereva 发表于 2016-3-20 22:14
把scf(maxcyc=400,conver=8)  iop(2/16=2,2/17=2)都去掉重新算再试

非常感谢！计算成功了，但是我还想请教您一下，去掉了这么多结果会不会和实验值相差太远了呢？

sobereva

节奏旅行家 发表于 2016-3-21 10:33
非常感谢！计算成功了，但是我还想请教您一下，去掉了这么多结果会不会和实验值相差太远了呢？

不可能
垃圾、多余的关键词，去掉反倒往往更合理
尤其是maxcyc设成好几百，专门在此文批斗过
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

节奏旅行家

sobereva 发表于 2016-3-21 11:38
不可能
垃圾、多余的关键词，去掉反倒往往更合理
尤其是maxcyc设成好几百，专门在此文批斗过

非常感谢sob大大！问题解决了！再次感谢！

莉莉

sobereva 发表于 2016-3-20 22:14
把scf(maxcyc=400,conver=8)  iop(2/16=2,2/17=2)都去掉重新算再试

王二葛

遇到了同样的问题

我是想在优化过程中强制保持对称性，所以加入了 IOp(2/16=2)，第一步 SCF 后就出现了大量的

1. Error in orthogonal basis= 5.46D-02 with     9 functions, increasing threshold to 1.68D+01.

复制代码

猜想是可能无法保持对称性，所以优化失败。去掉这个 IOp 就正常了

供参考