计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 4930|回复 Reply: 7
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 使用cp2k进行结构优化能量输出问题

[复制链接 Copy URL]

173

帖子

0

威望

1800

eV
积分
1973

Level 5 (御坂)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
使用cp2k对一个结构进行优化,Convergence check:四个收敛指标都YES。
图中 ENERGY| Total FORCE_EVAL ( QS ) energy [a.u.]:             -132.146373010317205

这个数据是不是优化完结构的整体能量。

为什么在GEOMETRY OPTIMIZATION COMPLETED之后还会再算一步,又得到一个

ENERGY| Total FORCE_EVAL ( QS ) energy [a.u.]:             -132.146373072488927

最终的能量应该取哪一个,谢谢各位老师。

202205191320031454..png (139.79 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

1

1
独立之精神 自由之思想

95

帖子

0

威望

1135

eV
积分
1230

Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2022-5-19 14:51:20 | 只看该作者 Only view this author
输出坐标文件的最后两帧结构好像一模一样
man

496

帖子

11

威望

4277

eV
积分
4993

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2022-5-19 16:32:52 | 只看该作者 Only view this author
读取最后一个能量就行,这个和QE类似,做完结构优化还会最后做一次单点任务,能量从最后一步读取。
自由发挥,野蛮生长

173

帖子

0

威望

1800

eV
积分
1973

Level 5 (御坂)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-19 18:02:09 | 只看该作者 Only view this author
丁越 发表于 2022-5-19 16:32
读取最后一个能量就行,这个和QE类似,做完结构优化还会最后做一次单点任务,能量从最后一步读取。

好的感谢
独立之精神 自由之思想

255

帖子

1

威望

2682

eV
积分
2957

Level 5 (御坂)

5#
发表于 Post on 2022-5-19 22:07:41 | 只看该作者 Only view this author
在密度泛函理论(中文版)的第79页脚注中,对于晶胞体积变化的计算可能会存在Pulay stress,因此需要多做一步单点消除掉,我一直是这么理解的,不知是否有误。

微信图片_20220519215946.png (174.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 20)

微信图片_20220519215946.png
我唯一知道的就是我一无所知,但我是化学小迷弟

173

帖子

0

威望

1800

eV
积分
1973

Level 5 (御坂)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-19 22:30:11 | 只看该作者 Only view this author
ChemG 发表于 2022-5-19 22:07
在密度泛函理论(中文版)的第79页脚注中,对于晶胞体积变化的计算可能会存在Pulay stress,因此需要多做一 ...

好的谢谢
独立之精神 自由之思想

39

帖子

3

威望

551

eV
积分
650

Level 4 (黑子)

7#
发表于 Post on 2022-5-26 11:02:53 | 只看该作者 Only view this author
我个人觉得这类似于VASP的单点计算,应该是为了在优化的结构基础上进一步算能量,所以最终能量要取用“Geometry optimization completed”下面给出的能量。

173

帖子

0

威望

1800

eV
积分
1973

Level 5 (御坂)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-26 13:04:53 | 只看该作者 Only view this author
ma455173220 发表于 2022-5-26 11:02
我个人觉得这类似于VASP的单点计算,应该是为了在优化的结构基础上进一步算能量,所以最终能量要取用“Geom ...

好的,谢谢
独立之精神 自由之思想

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-20 06:42 , Processed in 0.169644 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list