MS做分子动力学模拟离子质量太小或者0质量该怎么解决

付之一生 · 发表于 Post on 2022-6-15 11:45:15

求助用packmol构键的一个锌离子团簇结构做动力学模拟出现

该怎么样设置参数

喵星大佬 · 发表于 Post on 2022-6-15 11:50:26

原子没设对

付之一生 · 发表于 Post on 2022-6-15 12:22:39

喵星大佬发表于 2022-6-15 11:50
原子没设对

我是用pakmol直接构建完拖进去了，还需要设置什么呢，刚刚接触MS

牧生 · 发表于 Post on 2022-6-15 14:42:59

都用packmol这么好的东西了，那就不要用Ms把自己档次拖下去了，用gromacs多好啊。

如果非要用ms，那就用ms自带的ac去建模。

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