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[GROMACS] 求助,GROMACS在做氢键分析时出错

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各位老师好,用GROMACS做氢键分析时候出错,这种怎么解决啊



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发表于 Post on 2022-6-20 17:13:22 | 只看该作者 Only view this author
把fatal error下面那行字读一遍,你就知道原因了。然后你肯定就会知道解法
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-20 17:14:29 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2022-6-20 17:13
把fatal error下面那行字读一遍,你就知道原因了。然后你肯定就会知道解法

读了,不懂,求大神告知

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发表于 Post on 2022-6-20 17:16:21 | 只看该作者 Only view this author
至少会用百度翻译吧。

跑任务和分析所用gmx版本不一样。解决办法,换成相同版本
又菜又爱玩

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-20 18:23:32 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2022-6-20 17:16
至少会用百度翻译吧。

跑任务和分析所用gmx版本不一样。解决办法,换成相同版本

谢谢,我百度翻译了,就是不太确定,想问一下有编译好的2022windows版的gromacs 吗,我看社长发的链接只有2020版的

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发表于 Post on 2022-6-20 19:06:17 | 只看该作者 Only view this author
版本老了,换个比你分析的文件版本更高的就行,无论win还是linux

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-20 19:35:01 | 只看该作者 Only view this author
Jotaro 发表于 2022-6-20 19:06
版本老了,换个比你分析的文件版本更高的就行,无论win还是linux

好的谢谢,Linux是2022版的,我不会在linux系统上用GROMACS做一些分析,大佬知道吗?

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发表于 Post on 2022-6-20 20:02:47 | 只看该作者 Only view this author
小柏桐 发表于 2022-6-20 19:35
好的谢谢,Linux是2022版的,我不会在linux系统上用GROMACS做一些分析,大佬知道吗?

windows和linux下的gmx使用没任何差别

用vmware虚拟机装个linux系统,自己编译一个linux版的2022的gmx
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-20 21:11:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-20 20:02
windows和linux下的gmx使用没任何差别

用vmware虚拟机装个linux系统,自己编译一个linux版的2022的gmx ...

老师,有linux版的gmx的编译教程吗?

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发表于 Post on 2022-6-20 23:49:19 | 只看该作者 Only view this author
小柏桐 发表于 2022-6-20 21:11
老师,有linux版的gmx的编译教程吗?

GROMACS的安装方法(含全程视频演示)
http://sobereva.com/457http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-21 12:20:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-20 23:49
GROMACS的安装方法(含全程视频演示)
http://sobereva.com/457(http://bbs.keinsci.com/thread-11821- ...

谢谢老师,安装好了

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