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[新手求助] 求助反应路径优化过程中出现无势垒

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楼主
老师您好,我想问下如果反应无势垒,那么可以通过比较反应前后的吉布斯自由能判断反应的难易吗?这个时候如果吉布斯自由能越负,可不可以认为反应越容易进行。
老师还有一个问题,我的反应是在溶液中进行的,而且根据我的实验结果这个反应非常容易进行,反应为钴离子与亚硫酸盐络合,Co(II) + SO32- → CoSO3 这个反应有没有可能是无势垒的?
老师,我是新手小白,问的问题不太专业,希望老师能帮忙解答。

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发表于 Post on 2022-6-22 16:02:07 | 只看该作者 Only view this author
不能,应该用https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.organomet.8b00456的方法,或者https://aip.scitation.org/doi/10.1063/1.1539035的方法来判断,还有一种方法是跑AIMD来判断。
有可能,但是注意计算的时候必须做显式溶剂化
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-23 08:05:27 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-22 16:02
不能,应该用https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.organomet.8b00456的方法,或者https://aip.scitation. ...

好滴,感谢老师

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4#
发表于 Post on 2025-6-24 10:38:59 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-22 16:02
不能,应该用https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.organomet.8b00456的方法,或者https://aip.scitation. ...

老师,对于KOH+H=K+H2O,A+B=C+D这样的反应,baik的方法好像就不能用了,对于AIMD的方法,用cp2k能做吗?有什么文章可以看吗?

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发表于 Post on 2025-6-24 10:57:36 | 只看该作者 Only view this author
didiao 发表于 2025-6-24 10:38
老师,对于KOH+H=K+H2O,A+B=C+D这样的反应,baik的方法好像就不能用了,对于AIMD的方法,用cp2k能做吗? ...

这是少数几个气相小分子之间的反应,还是涉及凝聚相(比如固态KOH或者液态水)或者大量气相分子(需要统计不同物种出现情况之类的分析)的反应?既然在此帖讨论,之前是如何得出这个反应无势垒的结论的,具体计算细节如何?

AIMD(或者说BOMD)适合用什么软件跑看具体结构:如果是前者,适合用ORCA按孤立体系跑,参考http://sobereva.com/576;如果是后者,适合用CP2K按周期性体系跑。
√546=23.36664289109

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发表于 Post on 2025-6-24 11:01:33 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzkchem5 于 2025-6-24 11:02 编辑
didiao 发表于 2025-6-24 10:38
老师,对于KOH+H=K+H2O,A+B=C+D这样的反应,baik的方法好像就不能用了,对于AIMD的方法,用cp2k能做吗? ...

A+B=C+D这种反应,当A和B带的不是同号电荷,且C和D带的不是同号电荷的时候,必然存在一个单分子中间体I,也就是可以拆成A+B=I和I=C+D两步。
反证法,假如A+B=C+D放热且没有任何中间体,那么由A+B到C+D的能量是单调下降的,因此C和D的相互作用是纯粹排斥的。但是C和D之间必然有范德华吸引作用(O(1/R^6)),唯一比O(1/R^6)衰减得慢、而且不管怎么调整分子取向都是排斥作用的分子间相互作用是monopole-monopole Coulomb作用(O(1/R)),但由假设C和D带的不是同号电荷,矛盾。A+B=C+D吸热时,把以上论证的A和C交换,B和D交换即可。
AIMD用CP2K能做,ORCA也能做(在https://www.faccts.de/docs/orca/6.1/manual/index.html里搜AIMD)
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2025-6-24 15:47:41 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-6-24 10:57
这是少数几个气相小分子之间的反应,还是涉及凝聚相(比如固态KOH或者液态水)或者大量气相分子(需要统 ...

老师好,是气态下的反应,主要是想计算反应速率,细节方面,把H放的离KOH不管是近还是远都会优化成K+H2O,用gaussian找过渡态也找不到,会形成H-K-O-H的一个复合物的东西,但是他的虚频方向也不对,所以我感觉他是无势垒的,对于做AIMD,我不知道怎么得到自由能曲线

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发表于 Post on 2025-6-24 18:28:57 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-6-24 11:01
A+B=C+D这种反应,当A和B带的不是同号电荷,且C和D带的不是同号电荷的时候,必然存在一个单分子中间体I, ...

那老师,1.对于KOH+H·=K+H2O这种ABCD都是电中性的该怎么办呢?他有类似的中间态吗?2.如果计算AIMD该怎么得到自由能曲线呢?

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发表于 Post on 2025-6-24 19:05:53 | 只看该作者 Only view this author
didiao 发表于 2025-6-24 18:28
那老师,1.对于KOH+H·=K+H2O这种ABCD都是电中性的该怎么办呢?他有类似的中间态吗?2.如果计算AIMD该怎 ...

1. 肯定有。你把KOH和H放在一起优化,应该能优化出一个范德华络合物,这就是中间体
2. 做metadynamics,参见https://doi.org/10.1021/acs.jctc ... VoR&rel=cite-as
Zikuan Wang
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