安装GPU加速版的gromacs报错

peixing · 发表于 Post on 2022-7-15 11:36:04

老师好：
安装GPU加速版的gromacs时，报错如图片所示，能指出是什么问题吗？是严格按您给的教程安装的，但GUP加速这里教程比较简略，不知道哪里出了问题

abin · 发表于 Post on 2022-7-15 11:37:40

换个GPU.

你手里这个太古老了.

牧生 · 发表于 Post on 2022-7-15 11:41:20

因为gmx版本较低，你试试装2021.5，或许可以解决你的问题。

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2022-7-15 13:32:33

牧生发表于 2022-7-15 11:41
因为gmx版本较低，你试试装2021.5，或许可以解决你的问题。

2021.6有关于GPU加速的重要bug修复，不必推荐2021.5了

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2022-7-15 13:38:18

本帖最后由 Entropy.S.I 于 2022-7-15 13:40 编辑

改用Rocky Linux 9.0或Ubuntu 20.04（Ubuntu 22.04在9月更新到22.04.1后也可用），改用GMX 2021.6，配合CUDA ToolKit 11.2及以上版本和最新NVIDIA驱动。

若无极特殊需求，古董版本不必用了

peixing · 发表于 Post on 2022-7-15 15:03:40

Entropy.S.I 发表于 2022-7-15 13:38
改用Rocky Linux 9.0或Ubuntu 20.04（Ubuntu 22.04在9月更新到22.04.1后也可用），改用GMX 2021.6，配合CUD ...

那就是还要升级系统和软件，系统有其他文件，gmx2016配合cuda11.7和RTX2080TI的显卡的最新驱动是不兼容的吗？那我换回gmx兼容的显卡驱动和cuda是不是可以解决

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2022-7-15 15:49:44

peixing 发表于 2022-7-15 15:03
那就是还要升级系统和软件，系统有其他文件，gmx2016配合cuda11.7和RTX2080TI的显卡的最新驱动是不兼容的 ...

有什么特殊需求一定要用古董版GMX吗？若没有，就用新版本。如果CUDA ToolKit 11.7和最新NVIDIA GPU驱动都已正确安装、FFTW3已正确编译、Cmake版本是较新的，那么现在直接编译GMX2021.6不会有问题。

另外，现在已经不推荐用CentOS，没必要抱着它不放。装个新系统从0配置环境，比在现有环境上折腾轻松多了。

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