结构优化成功完成，但是能量输出下面存在警告

半亩心田种清欢

老师好，新手小白想向您请教，我是用MS中的CASTEP模块来做结构优化，优化完成.castep文件 BFGS: Geometry optimization completed successfully.但是在输出能量下面有 WARNING: Your unit cell might be too small to get accurate results for van der Waals。我的体系中原子构成是：C32 H O2 Pt，优化完后盒子大小为：9.86248、9.84155、15.8411（图体系1），我按照WARNING提示将体系原子构成改为C50 H O2 Pt，优化完后盒子大小为12.2895、12.2975、20.6086（图体系2），优化完成后还是出现同样的警告，两次优化参数设置一样（见下图），请问老师我这个问题应该怎么解决呢？另外，我每次优化完成Final energy 下面总有(energy not corrected for finite basis set)，出现这个的提示的原因是什么呢，要怎么解决呢？感谢老师解答！

乐平

从截图的结构来看，你计算的是吸附分子在石墨烯表面的催化反应吧？
你的真空层厚度有 20 Å 应该足够了。有可能是相邻周期里的吸附分子之间的相互作用造成的警告。

你可以在空白处点击鼠标右键，在弹出的对话框中选择 Lattice 选项卡，将 a， b 两个方向增加晶胞为 2 显示相邻的晶胞，然后用距离工具量一下相邻晶胞里的吸附分子之间的最小距离。 至少 15 Å 的距离才能保证相邻两个晶胞的小分子之间没有相互作用。

半亩心田种清欢

乐平 发表于 2022-8-12 11:57
从截图的结构来看，你计算的是吸附分子在石墨烯表面的催化反应吧？
你的真空层厚度有 20 Å 应该足够 ...

感谢老师的回答，我这个结构优化想看Pd修饰的氧化石墨烯这种构型方式是怎样的，我按照您说的测量方法得到的相邻晶胞里面Pd距离为12Å ，我在增到一下石墨烯基底中C原子的个数使Pd原子之间的距离增大到15A，重新进行结构优化看看，再次谢谢您的回答

Eudaimonia

你这个Pd在石墨烯上的存在方式有大问题，你这个Pd原子单靠一个Pd-C键是不可能稳定的