VASP计算时怎么固定部分原子?

aurberon · 发表于 Post on 2023-2-27 13:35:12

VASP计算时怎么固定部分原子? 是不是只需要在POSCAR的文本文件中加入一行Selective dynamics，以及每个原子坐标后面需要加 T（放开优化）和 F（固定坐标）？INCAR里面是否还有相应设置？
求大神指点

PESPES · 发表于 Post on 2023-2-27 14:10:44

只需要修改POSCAR即可，如果需要三个方向都固定，需要在坐标后加 F F F .

aurberon · 发表于 Post on 2023-2-27 14:59:15

好的新手没做过确认一下这下放心了

淦饭青年 · 发表于 Post on 2023-2-28 20:26:14

vaspkit的402功能可以固定原子

wypkdhd · 发表于 Post on 2023-2-28 21:55:42

楼上说的对，没必要自己加，vaspkit解决一切问题。这里给你两条路：（1）把结构通过vesta也好，其他的也行，导出成cif格式，在ms软件里面固定，然后保存的.xsd文件上传服务器，通过vaspkit 106功能直接变为poscar。（2）在拥有poscar的文件夹里面，直接通过402功能固定，具体可去vaspkit官网找相关说明，值得注意的是，如果用402固定或者放开，是根据催化剂层数来决定的，如果想省事，就设置个大点的数值，全部固定，然后用notepad++打开poscar，把需要改的FFF或者TTT自行替换成需要的。

aurberon · 发表于 Post on 2023-3-1 08:05:48

谢谢指导
我找到一个脚本在MS里建好模型用脚本自动生成POSCAR 里面有对固定的原子设置F

duchenggong · 发表于 Post on 2023-3-1 10:21:28

本帖最后由 duchenggong 于 2023-3-1 10:23 编辑

我是用MS导出成cif格式之后，再用VESTA导出成.vasp，上传到平台上，改成POSCAR就行了。固定的话，可以用vaspkit，比较新的版本的vaspkit支持多种方式组合来固定，可以根据原子种类，原子序号，高度等，也可以选择再XYZ哪个方向固定。序号用VESTA看就行，自己就会生成POSCAR_FIX文件，cp 成POSCAR就可以了。

leixiaocui · 发表于 Post on 2024-11-29 15:46:30

您好，使用脚本的时候有什么注意事项吗?我在使用的时候输出的好像有些错误，可能是我坐标轴的问题，希望解答

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