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[CP2K] cp2k跑结构优化时老是中途停止,续算后又能继续跑,但可能又中途停止在类似的位置

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直接用的是老师课程里的一个输入文file\opt\black_P\basis_set\DZVP-MOLOPT-GTH\DZVP-MOLOPT-GTH.inp第一次停在
然后直接拿.restart 在新的文件夹中续算,计算接上了,但是停到了第九次同样的位置


想请教老师大概是什么原因

我拿自己的体系也有这种一样的情况,续算就正常了,有时候也能一直正常

DZVP-MOLOPT-GTH.out

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第一次

PBEsol-1.out

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续算

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发表于 Post on 2023-5-3 17:17:10 | 只看该作者 Only view this author
如果你是指程序自动退出,而不是卡住,说明装得有问题
如果是卡住,用ssmp版或不同核数并行再试
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-3 17:45:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-3 17:17
如果你是指程序自动退出,而不是卡住,说明装得有问题
如果是卡住,用ssmp版或不同核数并行再试

谢谢老师的回复,就是我查看作业的状态,显示在run,但是输出文件并不更新,停在哪里。

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发表于 Post on 2023-5-3 18:01:18 | 只看该作者 Only view this author
预想 发表于 2023-5-3 17:45
谢谢老师的回复,就是我查看作业的状态,显示在run,但是输出文件并不更新,停在哪里。

就是我说的后一种情况
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-3 18:03:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-3 18:01
就是我说的后一种情况

好嘞,谢谢老师的回复~

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发表于 Post on 2023-11-27 17:41:25 | 只看该作者 Only view this author
您好,我也遇到同样问题,卡在 extrapolation method.........那里。换成ssmp可以跑,但速度比popt慢很多。你找到更好的解决方式嘛。

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发表于 Post on 2023-12-4 15:22:53 | 只看该作者 Only view this author
遇到了相同的问题,这是CP2K自身的bug吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-4 15:53:23 | 只看该作者 Only view this author
chemistryMaga 发表于 2023-12-4 15:22
遇到了相同的问题,这是CP2K自身的bug吗

我觉得是的。。。换成ssmp不会卡,但速度慢了好几倍

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-4 15:56:39 | 只看该作者 Only view this author
Geocmpt 发表于 2023-11-27 17:41
您好,我也遇到同样问题,卡在 extrapolation method.........那里。换成ssmp可以跑,但速度比popt慢很多。 ...

不用2023的两个版本,用2022版本卡的情况好点,建议用2022试试。2022不行我的解决办法也只有换成ssmp版本。。

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发表于 Post on 2023-12-5 10:23:09 | 只看该作者 Only view this author
预想 发表于 2023-12-4 15:56
不用2023的两个版本,用2022版本卡的情况好点,建议用2022试试。2022不行我的解决办法也只有换成ssmp版本 ...

我用的就是2023版本的,现在是停了就杀掉用.restart续跑

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发表于 Post on 2023-12-6 13:57:28 | 只看该作者 Only view this author
chemistryMaga 发表于 2023-12-5 10:23
我用的就是2023版本的,现在是停了就杀掉用.restart续跑

请问下,cp2k续算要在脚本文件里怎么设置读取之前的波函数啊。谢谢

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发表于 Post on 2023-12-6 14:14:37 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wolfli369 于 2023-12-6 14:16 编辑
Geocmpt 发表于 2023-11-27 17:41
您好,我也遇到同样问题,卡在 extrapolation method.........那里。换成ssmp可以跑,但速度比popt慢很多。 ...

使用最新版Multiwfn重新生成相应的输入文件,重新跑一下

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发表于 Post on 2023-12-7 19:19:37 | 只看该作者 Only view this author
wolfli369 发表于 2023-12-6 14:14
使用最新版Multiwfn重新生成相应的输入文件,重新跑一下

最新版本的Multiwfn生成CP2K输入文件有区别嘛?我对比下没发现哪里有区别呢?

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发表于 Post on 2024-11-28 16:01:16 | 只看该作者 Only view this author
chemistryMaga 发表于 2023-12-5 10:23
我用的就是2023版本的,现在是停了就杀掉用.restart续跑

它这个没有单纯的.restart文件啊,只有一个restart.wfn文件,是不是要删掉后面的.wfn呢?

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发表于 Post on 2024-11-29 14:00:26 | 只看该作者 Only view this author
我也遇到过类似的情况,在超算上跑的,开了OT,可能是由于晶胞边长设置的不恰当导致了程序卡住,我扩胞以后设置多节点并行可以正常运行,你这情况有可能可以通过调节K点数量或者扩胞尝试一下
西安交通大学等离子体与微波电子学研究所
THz无损检测与光谱模拟
gonglr@stu.xjtu.edu.cn

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