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[GROMACS] gmx_MMPBSA_ana无法正常运行,无法对gmx_MMPBSA处理的结果作图

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本帖最后由 Jeffrey0521 于 2023-6-17 11:38 编辑

我的操作系统是CentOS7,用的GROMACS版本是2019.6,分子动力学模拟及gmx_MMPBSA计算一切正常。但是可视化工具gmx_MMPBSA_ana完全无法打开,一直停留在reading files的窗口,且终端有如下报错


qt.glx: qglx_findConfig: Failed to finding matching FBConfig for QSurfaceFormat(version 2.0, options QFlags<QSurfaceFormat::FormatOption>(), depthBufferSize -1, redBufferSize 1, greenBufferSize 1, blueBufferSize 1, alphaBufferSize -1, stencilBufferSize -1, samples -1, swapBehavior QSurfaceFormat::SingleBuffer, swapInterval 1, colorSpace QSurfaceFormat::DefaultColorSpace, profile  QSurfaceFormat::NoProfile)
No XVisualInfo for format QSurfaceFormat(version 2.0, options QFlags<QSurfaceFormat::FormatOption>(), depthBufferSize -1, redBufferSize 1, greenBufferSize 1, blueBufferSize 1, alphaBufferSize -1, stencilBufferSize -1, samples -1, swapBehavior QSurfaceFormat::SingleBuffer, swapInterval 1, colorSpace QSurfaceFormat::DefaultColorSpace, profile  QSurfaceFormat::NoProfile)
Falling back to using screens root_visual.


网络上检索,类似都是QT3D出了问题,都是改代码。我检查了conda pip的确是安装了pyqt5的,有无遇到相同的情况,求解。

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发表于 Post on 2023-6-17 12:55:43 | 只看该作者 Only view this author
知乎上有个gmx mmpbsa的安装帖子 它里面配的环境比较好,我之前参照官网的教程配环境都会出现报错,建议去看看知乎那篇

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-17 14:17:31 | 只看该作者 Only view this author
Huschein 发表于 2023-6-17 12:55
知乎上有个gmx mmpbsa的安装帖子 它里面配的环境比较好,我之前参照官网的教程配环境都会出现报错,建议去 ...

你说的是https://zhuanlan.zhihu.com/p/528893992
我就是按照这个安装的,但是还是不行

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发表于 Post on 2023-6-18 10:06:42 | 只看该作者 Only view this author
Jeffrey0521 发表于 2023-6-17 14:17
你说的是https://zhuanlan.zhihu.com/p/528893992吗
我就是按照这个安装的,但是还是不行

对的,你按照它的,然后再参考官网的环境配置,我记得我是两个混搭,因为报错原因是某个库版本的更新,这篇知乎也有一点年头了,具体的话你得看py报错在哪里了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-18 22:38:42 | 只看该作者 Only view this author
Huschein 发表于 2023-6-18 10:06
对的,你按照它的,然后再参考官网的环境配置,我记得我是两个混搭,因为报错原因是某个库版本的更新,这 ...

正常.py没问题,只是最后打开可视化界面打开才有问题,报错我都截图在上面了,就是因为不知道具体是哪个包出问题了才过来问的,这不能全部重新装一遍吧,毕竟结果的dat文件是出来了的。

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发表于 Post on 2023-11-1 12:31:22 | 只看该作者 Only view this author
Unable to start gmx_MMPBSA_ana,大家有遇到这个报错么,怎么处理啊

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发表于 Post on 2023-11-1 15:11:56 | 只看该作者 Only view this author
我也是遇到可视化有问题,但数据都是能够正常显示的,自己作图就好了
不羡大神不羡仙,努力学习每一天

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发表于 Post on 2024-3-24 16:36:19 | 只看该作者 Only view this author
keplerze 发表于 2023-11-1 12:31
Unable to start gmx_MMPBSA_ana,大家有遇到这个报错么,怎么处理啊

你好,麻烦问一下你这个问题处理好了么?

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