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[CP2K] cp2k 做AIMD电子步时间突然暴涨

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楼主
各位老师好,我用cp2k做AIMD时会出现电子步时间突然暴涨的情况,经测试在其他电脑/服务器上均没问题。只有在一台电脑上会出现这个问题,并且2022.2和2023.1版本都会出现同样问题。更改输入文件的收敛标准也会出同样的问题。不知道是电脑的哪个部分出了问题,现在是毫无头绪不知从何查起。附上我的输入和输出文件。衷心希望各位老师能够指点。

cp2k.out

16.85 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

test.inp

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发表于 Post on 2023-7-12 09:12:19 | 只看该作者 Only view this author
看一下输出的轨迹文件是不是发生了很大的结构变动。
独立之精神 自由之思想

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-12 09:29:46 | 只看该作者 Only view this author
yjb 发表于 2023-7-12 09:12
看一下输出的轨迹文件是不是发生了很大的结构变动。

没有,因为在第一个step就出现了这种情况

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发表于 Post on 2023-7-12 09:37:31 | 只看该作者 Only view this author
既然其它机子上都没问题,那就是这个机子上编译、运行环境或者硬件的问题
确保机子里没有其它明显占CPU的任务捣乱。并且检验给不同并行核数时的情况
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-12 20:52:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-7-12 09:37
既然其它机子上都没问题,那就是这个机子上编译、运行环境或者硬件的问题
确保机子里没有其它明显占CPU的 ...

并行核数越少,电子步暴涨出现的步数就越迟。然后我手贱设置了export OMP_NUM_THREADS=1, export TF_INTRA_OP_PARALLELISM=0, export TF_INTER_OP_PARALLELISM=0之后,从第一个电子步开始时间就原来的几十倍。请问一下sob老师有什么排除故障的方法吗,或者是这种情况下重装系统会不会变好?

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发表于 Post on 2023-7-13 05:59:54 | 只看该作者 Only view this author
Weldingspock 发表于 2023-7-12 20:52
并行核数越少,电子步暴涨出现的步数就越迟。然后我手贱设置了export OMP_NUM_THREADS=1, export TF_ ...

可以使用与之前不同的CP2K版本和MPI库编译试试
如果系统里没什么重要东西,重装系统不麻烦,也可以试试,不过大概率这个没什么用
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-13 09:52:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-7-13 05:59
可以使用与之前不同的CP2K版本和MPI库编译试试
如果系统里没什么重要东西,重装系统不麻烦,也可以试试 ...

好的,我试一试,谢谢老师

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