计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 594|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 静态相关可能比较强的氮宾插入反应计算的问题

[复制链接 Copy URL]

49

帖子

0

威望

810

eV
积分
859

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
最近打算计算一个Rh(II) (Rh2(esp)2或Rh2(OAc)4)催化的氮宾插入反应,体系大概有总共100个左右的原子。铑催化剂中包含Rh-Rh键,后续的反应也可能包含双自由基中间体,静态相关可能比较强,所以准备先用纯泛函计算。有几个问题想咨询一下各位老师:
1. 如果后续考虑做更高精度的多参考计算,比如MOLCAS的CASPT2,这么大的体系有可能算得动吗?
2. 如果不用MOLCAS的话,ORCA现在的多参考方法支持的怎么样?翻了翻论坛上前几年的帖子,似乎评价都不太高。
3. 文献用M06L的比较多,也有用PBE的。用这个级别算出的能量可靠吗?如果不考虑多参考计算,在DFT层面有没有更好的选择?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112492

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-7-13 12:34:25 | 只看该作者 Only view this author
ORCA的NEVPT2做得挺不错,效率很高

M06L、PBE都过时了,甭用。
考虑r2SCAN、MN15L、B97M-rV。如果反应不涉及Rh-Rh键的明显改变,用杂化泛函也未尝不可
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

49

帖子

0

威望

810

eV
积分
859

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-13 17:03:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-7-13 12:34
ORCA的NEVPT2做得挺不错,效率很高

M06L、PBE都过时了,甭用。

多谢sob老师解答!还有两个问题想请教一下
1. 我刚刚大概看了一眼ORCA的手册,NEVPT2似乎有几种实现,计算时是不是直接用DLPNO-NEVPT2就可以了?
2. 计算中可能会涉及高自旋态(三重态)的中间体和过渡态,这些泛函计算高自旋怎么样?

3814

帖子

4

威望

8002

eV
积分
11896

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

4#
发表于 Post on 2023-7-14 11:16:16 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2023-7-14 19:36 编辑

泛函的选择见《简谈量子化学计算中DFT泛函的选择》http://sobereva.com/272,我个人推荐unrestricted BP86。

现在这个年头不推荐用CASPT2了。你的体系很大,用多参考态微扰方法顶多只能算单点,没法结构优化。

NEVPT2两种实现一般指的是FIC-NEVPT2(也即PC-NEVPT2)和SC-NEVPT2,计算量和精度按这个顺序极其微小地降低,用哪个都行,支持的量子化学程序很多,我个人推荐PySCF>Molpro≈ORCA>BDF>OpenMolcas。

DLPNO-一般称为局域相关方法或加速手段。在传统NEVPT2能算的动的情况下,不要用DLPNO-NEVPT2(当然了,你的体系比较大,确实要用DLPNO-NEVPT2,这个目前只有ORCA支持)。另外,多参考态微扰方法的计算量不仅与基组有关,还与活性空间大小有关,DLPNO-NEVPT2适用于中等分子、大基组、小活性空间;DMRG-NEVPT2适用于中小分子中等基组、大活性空间;理想方法DLPNO-DMRG-NEVPT2还没人实现出来,所以如果你要算中等、大分子、大基组、大活性空间,NEVPT2这条路就走不通了,届时如果不幸遇到这种情况,可以改用DMRG-PDFT(PySCF和OpenMolcas支持)。

最后给MOKIT程序打一下广告,上述所有多参考微扰方法、所有量子化学程序,MOKIT都支持自动确定活性空间、自动构造活性轨道、自动调用,输入文件只需高斯gjf,方法名就写NEVPT2,为了让用户没有学习成本。哪怕不让程序自动算,也可以通过MOKIT丰富的传轨道小程序 自由地切换量子化学程序进行计算。例子见
https://jeanwsr.gitlab.io/mokit-doc-mdbook/chap5-1.html
https://gitlab.com/jxzou/qcinsta ... -%E6%B5%8B%E8%AF%95
自动做多参考态计算的程序MOKIT

49

帖子

0

威望

810

eV
积分
859

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-14 16:36:42 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-7-14 11:16
泛函的选择见《简谈量子化学计算中DFT泛函的选择》http://sobereva.com/272,我个人推荐unrestricted BP86 ...

多谢老师解答!泛函方面,我目前先用MN15L算一下,如果不理想再考虑换泛函。

我目前想法是在DFT下优化及振动分析,再用多参考的方法计算一下单点能,类似DLPNO-CCSD(T)的用法,这样做可行吗?还是说应该用多参考方法优化几何结构再计算?

还有就是您提到最好用传统的NEVPT2计算,DLPNO近似会损失很多精度吗?如果跟DLPNO-CCSD(T)的程度差不多,那似乎可以接受。

3814

帖子

4

威望

8002

eV
积分
11896

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

6#
发表于 Post on 2023-7-14 19:39:55 | 只看该作者 Only view this author
wangzuwei 发表于 2023-7-14 16:36
多谢老师解答!泛函方面,我目前先用MN15L算一下,如果不理想再考虑换泛函。

我目前想法是在DFT下优化 ...

可行。不过要注意NEVPT2全称CASSCF-NEVPT2,是要先确定/挑选/构造活性轨道做CASSCF的,然后才读取轨道做NEVPT2,不是像DLPNO-CCSD(T)那样的黑箱方法,这也是我上面介绍了很多信息的原因。另,结构优化做不了,也算不动。

损不损失精度与DLPNO-后面接NEVPT2还是CCSD(T)关系不大,与你的关键词关系比较大,比如至少要TightSCF和TightPNO。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

49

帖子

0

威望

810

eV
积分
859

Level 4 (黑子)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-15 16:19:59 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-7-14 19:39
可行。不过要注意NEVPT2全称CASSCF-NEVPT2,是要先确定/挑选/构造活性轨道做CASSCF的,然后才读取轨道做N ...

多谢指导!我回头研究一下

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 00:51 , Processed in 0.181723 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list