请教CP2K输出文件的问题

clearlove · 发表于 Post on 2023-7-18 10:08:32

请问老师们优化后的结构我应该在哪个文件如何打开啊？
2.输入文件编译了mol文件的输出，但输出没有mol文件应该怎么办？

乐平 · 发表于 Post on 2023-7-18 10:40:02

本帖最后由乐平于 2023-7-18 10:52 编辑

XXXX-pos-1.pdb 文件是最终的结构文件，其中 XXXX 是你自己命名的体系名，比如你截图里的 MIX2， pos 是 position 的缩写，而 .pdb 是以 pdb 格式保存的文件后缀名。

什么叫“输入文件里‘编译’了 mol 文件的输出”……

你输出的格式明明写的是 pdb

&PRINT
&TRAJECTORY
FORMAT pdb
&END TRAJECTORY

复制代码

在你上传的 MIX3.inp 文件末尾倒数第十行至倒数第八行

clearlove · 发表于 Post on 2023-7-18 11:48:51

谢谢您是我的表达有问题但是我也写了print mol在后面您可以看看是不是因为K点体系无法输出呢

乐平 · 发表于 Post on 2023-7-19 10:20:12

clearlove 发表于 2023-7-18 11:48
谢谢您是我的表达有问题但是我也写了print mol在后面您可以看看是不是因为K点体系无法输出呢

真的吗？请看截图，您在上传的 MIX3.inp 文件的哪里写了 print mol ?

即使我搜 MOL, mol 也只搜到 BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH-qXX，这里的 XX 指代文件里的 q12, q17, q6, q18，以及 &MO_MOLDEN, &END MO_MOLDEN 这些关键词。根本就没有在您上传的 MIX3.inp 文件里找到 print mol

请您自己好好检测一下吧

sobereva · 发表于 Post on 2023-7-20 13:11:43

restart文件里就有最终结构，而且是全精度储存，拷出来就完了。还可以将之载入Multiwfn，用主功能100的主功能2转成丰富的格式，诸如cif、xyz、pdb、gjf等等

clearlove · 发表于 Post on 2023-8-1 17:09:02

sobereva 发表于 2023-7-20 13:11
restart文件里就有最终结构，而且是全精度储存，拷出来就完了。还可以将之载入Multiwfn，用主功能100的主功 ...

谢谢您已经解决

clearlove · 发表于 Post on 2023-8-1 17:09:26

乐平发表于 2023-7-19 10:20
真的吗？请看截图，您在上传的 MIX3.inp 文件的哪里写了 print mol ?

不好意思是我没看到谢谢了

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[CP2K] 请教CP2K输出文件的问题