刚性扫描后，如何粗略估计旋转势垒

Juncheng_Lei · 发表于 Post on 2024-1-4 11:03:55

老师，你好
我对一个分子进行了二面角的刚性扫描，扫描曲线如左图所示，我想粗略估计旋转能垒。那极大点和相邻极小点的选择应该是如右图红色部分那样来估算能垒吗？

sobereva · 发表于 Post on 2024-1-4 11:11:11

别拿这个估计。优化对应的二面角旋转过渡态，然后用其能量与相邻极小点的求差来算

Juncheng_Lei · 发表于 Post on 2024-1-4 11:37:26

sobereva 发表于 2024-1-4 11:11
别拿这个估计。优化对应的二面角旋转过渡态，然后用其能量与相邻极小点的求差来算

谢谢老师.
那我应该用极大点的结构去找过渡态，然后优化相邻的极小点（而不是起始结构能量最低点）。最后根据能量求差得到。是这样吗？

zjxitcc · 发表于 Post on 2024-1-4 11:39:01

能轻易准确计算的事情不要估算

sobereva · 发表于 Post on 2024-1-5 10:18:42

Juncheng_Lei 发表于 2024-1-4 11:37
谢谢老师.
那我应该用极大点的结构去找过渡态，然后优化相邻的极小点（而不是起始结构能量最低点）。最 ...

用起始结构对应的极小点还是TS相邻极小点算势垒，取决于实际目的

Juncheng_Lei · 发表于 Post on 2024-1-5 10:52:41

sobereva 发表于 2024-1-5 10:18
用起始结构对应的极小点还是TS相邻极小点算势垒，取决于实际目的

老师，我想计算的是分子中的甲基基团旋转时的能垒。由于这个分子的起始结构是优化好的全局最小点，在这种情况下，我应该比较起始点与TS的能量差吧？

sobereva · 发表于 Post on 2024-1-5 11:03:10

Juncheng_Lei 发表于 2024-1-5 10:52
老师，我想计算的是分子中的甲基基团旋转时的能垒。由于这个分子的起始结构是优化好的全局最小点，在这种 ...

是

Juncheng_Lei · 发表于 Post on 2024-1-5 17:14:33

sobereva 发表于 2024-1-5 11:03
是

好的，谢谢老师

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[新手求助] 刚性扫描后，如何粗略估计旋转势垒